机动车存在两个车架号属于违法行为，具体处罚需根据车辆来源、使用情况及主观故意程度综合判定，可能面临行政处罚、车辆没收甚至刑事责任。以下从不同法律角度展开分析：

一、行政处罚层面（核心依据《道路交通安全法》及实施条例）

1. 车辆登记环节
   车架号（VIN码）是机动车的法定唯一身份标识，根据《机动车登记规定》第九条，申请注册登记时需提交包含车架号的合格证明。若车辆存在两个车架号：

   • 生产环节问题：若因制造商错误导致（如模具重复使用），需由生产企业出具证明并召回整改，否则无法通过车管所查验，无法上牌；
   • 非法改装：若为后期私自篡改（如套用其他车辆车架号），车管所将直接不予登记，并依据《道路交通安全法》第一百条，扣留车辆、责令恢复原状，并处500元以下罚款。

2. 使用环节查处
   已登记车辆若被发现存在两个车架号：

   • 主观故意套牌：依据《道路交通安全法》第九十六条，收缴号牌、扣留车辆，处2000-5000元罚款，并处15日以下拘留；构成犯罪的（如涉及盗抢车辆），依法追究刑事责任；
   • 过失导致（如维修后未恢复）：通常责令限期整改，逾期未改的处警告或20-200元罚款。

二、刑事责任层面（核心依据《刑法》）

若两个车架号涉及以下情形，可能触犯刑法：

1. 生产、销售伪劣产品罪
   若制造商故意在车辆上标注两个车架号以逃避监管（如降低排放标准、隐瞒缺陷），且销售金额达5万元以上，依据《刑法》第一百四十条，处2年以下有期徒刑或拘役，并处或单处销售金额50%-2倍罚金。

2. 诈骗罪
   若通过篡改车架号将事故车、盗抢车伪装成正常车辆销售，数额较大的（如3000-1万元以上），依据《刑法》第二百六十六条，处3年以下有期徒刑、拘役或管制，并处或单处罚金。

三、实务建议

1. 对车主：立即停止使用车辆，联系车管所或检测机构核查车架号真实性；若涉及购买，保留购车合同、发票等证据，向销售方主张违约责任。
2. 对制造商：需主动召回问题车辆，配合监管部门调查，否则可能面临行政处罚及集体诉讼风险。

提示：车架号问题常与车辆来源合法性、改装合规性交织，具体处罚需结合车辆历史记录、改装证据等综合判定。如有进一步疑问，可直接向我提供车辆信息及事件细节，我将结合地方性法规给出针对性分析。