结论前置：子公司已经注销，劳动者与子公司之间曾经存在的劳动关系仍然可以被确认，关键在于收集充分的证据并按照法律程序主张权利。以下从多个角度进行详细分析：
一、劳动关系确认的基础与重要性
劳动关系的确认是基于劳动者与用人单位在存续期间实际发生的劳动用工事实。这一事实不会因子公司的注销而消失。确认劳动关系对于劳动者来说至关重要，它涉及到工伤认定、社保补缴、劳动报酬支付、经济补偿等一系列权益纠纷的解决。例如，如果劳动者在子公司工作期间发生了工伤，确认劳动关系是申请工伤认定和享受工伤保险待遇的前提。
二、证据收集
为了证明劳动关系的存在，劳动者需要积极收集并保存以下证据：
- 书面劳动合同：这是最直接且有力的证据，能够明确双方的权利和义务。如果劳动者与子公司签订了书面劳动合同，应妥善保管。
- 工资支付凭证或记录：包括工资条、银行工资流水、工资支付的短信或邮件通知等。这些证据能够证明劳动者曾从子公司获得报酬，是劳动关系存在的重要佐证。
- 工作证、服务证等身份证明：如盖有子公司公章的员工工作证、门禁卡等。这些证据能够证明劳动者的身份和与子公司的关联。
- 考勤记录：打卡记录、考勤表等可以反映劳动者的出勤情况和工作时间。如果子公司有完善的考勤制度，劳动者应尽可能收集这些证据。
- 其他劳动者的证言：同事的证人证言在一定程度上也可以作为证明劳动关系的证据。但需要确保证人具备相应的作证能力和条件，并且证言内容真实可信。
三、责任承担主体的确定
子公司注销后，确定责任承担主体是维护劳动者权益的关键。具体分为以下几种情况：
- 依法清算注销：如果子公司是依法进行清算并注销的，且清算报告中对员工权益等事项有妥善处理安排，那么应按照清算方案执行。但若清算存在瑕疵，如未依法通知劳动者、未对劳动债权进行清偿等，清算组成员可能需对劳动者的相关权益承担责任。
- 股东责任：若股东存在未足额出资、抽逃出资等损害债权人利益（包括劳动者权益）的情形，股东可能需在相应范围内对劳动者承担责任。例如，股东应出资但未足额出资的部分，可能成为其对劳动者承担责任的范围。
- 承继主体：如果子公司注销后，其业务、资产等被其他主体承继，那么承继单位可能需要对原子公司劳动者的权益负责。这包括承担原子公司与劳动者之间的相关劳动关系责任。
四、法律程序
确认劳动关系通常需要通过以下法律程序进行：
- 劳动仲裁：劳动者应向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，并提交仲裁申请书及相关证据材料。仲裁委员会受理后会安排开庭审理，并根据双方提交的证据和陈述进行裁决。这是解决劳动争议的首选方式。
- 诉讼：如果劳动者或单位对仲裁结果不服，可以在规定的期限内向有管辖权的人民法院提起诉讼。法院将依据民事诉讼程序进行审理和判决。这是劳动仲裁之后的进一步法律救济途径。
总结与建议：子公司注销并不影响劳动者确认劳动关系及维护自身合法权益。关键在于劳动者要积极收集证据，了解责任承担主体的确定方式，并按照法律程序主张自己的权利。如果你在确认劳动关系或维护自身权益过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。