原企业2003年征地安置补偿不履行，这一行为是否合法，需结合具体情况判断，但通常情况下，不履行征地安置补偿协议是不合法的。以下从多个角度进行分析：

一、法律背景与原则

1. 依法补偿原则：根据《中华人民共和国土地管理法》及相关法律法规，国家征收土地时，必须依法给予被征地单位和个人公平、合理的补偿，并妥善安置被征地农民的生产和生活。这是征地补偿的基本原则，任何违反这一原则的行为都可能构成违法。

2. 协议效力：征地安置补偿协议是征地单位与被征地单位或个人之间就征地补偿事宜达成的书面协议，具有法律效力。双方应严格按照协议约定履行各自的义务。

二、不履行征地安置补偿协议的合法性分析

1. 协议内容合法且有效：如果征地安置补偿协议的内容合法、有效，且双方均已签字盖章确认，那么该协议对双方均具有约束力。企业作为征地单位，不履行协议约定的补偿义务，即构成违约，是不合法的。

2. 协议存在瑕疵或无效情形：虽然这种情况较为少见，但如果征地安置补偿协议存在重大误解、显失公平、欺诈、胁迫等情形，导致协议无效或可撤销，那么企业不履行协议可能有一定的法律依据。然而，这并不意味着企业可以随意不履行协议，而是需要通过法律程序来确认协议的无效或可撤销性，并据此作出相应处理。

3. 历史遗留问题：对于2003年的征地安置补偿问题，可能存在一些历史遗留因素，如政策变化、规划调整等。然而，这些因素并不能成为企业不履行补偿义务的合法理由。除非有明确的法律规定或政策文件支持企业不履行补偿义务，否则企业仍应按照协议约定履行补偿义务。

三、法律建议与后果

1. 法律建议：

   • 如果企业不履行征地安置补偿协议，被征地单位或个人可以首先与企业进行协商，寻求和解或达成补充协议。
   • 如果协商无果，被征地单位或个人可以向当地土地管理部门或相关政府部门投诉，请求政府介入调解或处理。
   • 必要时，被征地单位或个人还可以向人民法院提起诉讼，要求企业履行补偿义务并承担违约责任。

2. 法律后果：

   • 如果企业被认定不履行征地安置补偿协议，可能面临行政处罚、民事赔偿等法律后果。
   • 企业的信誉和形象也可能因此受到损害，影响其未来的经营和发展。

四、特殊情况考虑

• 政策变化：如果2003年征地后，相关政策发生了变化，且新政策明确规定了不履行原补偿协议的情形或处理方式，那么需要按照新政策执行。但这种情况较为特殊，且需要明确的政策文件支持。
• 不可抗力：如果因不可抗力因素（如自然灾害、战争等）导致企业无法履行补偿义务，且企业能够提供充分证据证明其无法履行的原因，那么可能在一定程度上免除其责任。但这种情况同样较为特殊，且需要严格的证据支持。

综上所述，原企业2003年征地安置补偿不履行，在通常情况下是不合法的。被征地单位或个人应积极维护自己的合法权益，通过协商、投诉或诉讼等方式要求企业履行补偿义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。