结论：别人车子停在您租的车库是否违法以及如何处理，需分情况讨论，主要取决于您与车库出租方之间的租赁合同约定以及车库的产权归属等情况。以下是具体分析：

1. 若您与车库出租方签订的租赁合同明确约定您对车库享有独占使用权

   • 违法性判断：在这种情况下，别人未经您允许将车子停在您租的车库，属于侵犯您对车库的合法使用权，是违法的行为。因为您基于租赁合同取得了在一定期限内对车库的独占使用权利，他人不得随意干涉和侵犯。
   • 处理方式：
     • 与车主沟通：首先可以尝试与车主友好协商，告知其该车库是您租赁使用的，要求其将车辆驶离。在沟通时，注意保留好相关的沟通记录，比如聊天记录、通话录音等，以备后续需要。
     • 联系物业或管理方：如果与车主沟通无果，您可以联系车库所在小区的物业或者车库的管理方，向他们说明情况，要求他们协助处理，让车主将车辆移走。物业或管理方有责任维护小区或车库的正常秩序。
     • 报警处理：若上述方式都无法解决问题，您可以拨打110报警，由警方介入处理。警方会根据具体情况，对车主进行批评教育或者采取其他相应的措施，以保障您的合法权益。
     • 起诉维权：如果因为车主的停车行为给您造成了经济损失，比如导致您无法正常使用车库而产生了额外的费用等，您可以收集好相关证据，如租赁合同、损失证明等，向法院提起民事诉讼，要求车主赔偿您的损失。

2. 若您与车库出租方签订的租赁合同未明确约定您对车库享有独占使用权，或者车库属于共有部分，您只是租赁了其中的一个停车位

   • 违法性判断：此时别人的停车行为不一定违法。如果车库是共有部分，其他共有人或者经过共有人同意的使用人在合理范围内使用车库停车，可能并不构成违法。但如果车主的停车行为影响了您对租赁停车位的正常使用，比如占用了您的停车位等，那么车主的行为就侵犯了您的合法权益。
   • 处理方式：
     • 查看合同和规定：先仔细查看您与出租方签订的租赁合同以及小区关于车库使用的相关规定，明确自己的权利和义务，以及车库的使用规则。
     • 与车主协商：同样可以先与车主友好沟通，说明情况，要求其规范停车，不要影响您的正常使用。
     • 寻求物业或管理方帮助：若协商不成，向物业或管理方反映情况，让他们根据车库使用规定进行处理，协调车主将车辆停放至合适位置。
     • 依据合同维权：如果因为车主的不当停车行为给您造成了损失，且您认为出租方在管理上存在过错，您可以依据租赁合同要求出租方承担相应的责任，比如协助您解决问题、赔偿您的损失等。如果出租方拒绝承担责任，您可以考虑通过法律途径解决，向法院提起诉讼。