关于三轮车停在机动车车位是否会被罚款以及罚款金额的问题，这主要取决于三轮车的性质以及当地的具体交通管理规定。
首先，我们需要明确三轮车的属性。根据相关法律和国家标准，三轮车如果以动力装置驱动或牵引，且设计最高时速、空车质量、外形尺寸等不符合非机动车的标准，那么它通常被认定为机动车，具体可能属于三轮摩托车类别。
接下来，我们分析三轮车停在机动车车位的情况：
如果三轮车被认定为机动车：
- 在大多数地区，机动车需要停放在指定的机动车停车位内。如果三轮车停在了机动车停车位，且没有违反其他交通规定（如逆向停车、占用消防通道等），那么通常不会因为停放本身而被罚款。
- 但是，如果三轮车未依法注册登记、悬挂机动车号牌，或者驾驶人未取得相应的机动车驾驶证，那么这些违法行为可能会面临罚款，甚至更严重的处罚，如行政拘留。不过，这些处罚与停放位置本身无直接关系，而是与车辆和驾驶人的合法性有关。
- 特定地区可能有针对三轮车的特殊管理规定。例如，某些地区可能禁止三轮车在特定时间段或特定区域内停放，或者对三轮车的停放有额外的要求。在这种情况下，如果三轮车违反了这些规定，就可能会被罚款。以您提供的参考信息为例，在重庆市万州区分水镇，驾驶三轮摩托车乱停乱放的，将按照违反禁令标志处罚款100元、记3分。
如果三轮车被认定为非机动车：
- 非机动车通常需要停放在指定的非机动车停车位内。如果三轮车被认定为非机动车却停在了机动车停车位，那么这可能构成违规停放，可能会面临罚款或拖移车辆等处罚。不过，具体处罚标准会因地区而异。
总结与建议：
- 要确定三轮车停在机动车车位是否会被罚款，首先需要明确三轮车的属性（机动车还是非机动车）以及当地的具体交通管理规定。
- 如果三轮车被认定为机动车，且停放位置符合当地规定，那么通常不会因为停放本身而被罚款。但需要注意车辆和驾驶人的合法性，避免其他违法行为。
- 如果三轮车被认定为非机动车，或者当地有针对三轮车的特殊管理规定，那么需要仔细了解并遵守这些规定，以避免违规停放带来的罚款或其他处罚。
- 由于不同地区的交通管理规定可能存在差异，因此建议您在停放三轮车前，先向当地交通管理部门或相关机构咨询清楚相关规定。