事业编长期病假不一定会被开除，具体需根据医疗期、员工能否继续工作以及是否存在违规行为等因素综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、医疗期内的保护
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》（事业单位可参照执行），员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，将根据实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 在医疗期内，员工享有病假工资或津贴，且单位不得随意解除聘用合同，这是对员工合法权益的保障。
病假申请流程：
- 员工在申请病假时，应按照单位规定的流程进行，并提供真实有效的病假证明，如医院的诊断书、病历等。这是确保病假合法性的重要步骤。
二、医疗期满后的处理
能否继续工作：
- 医疗期满后，若员工不能从事原工作，也不能从事由单位另行安排的工作，单位可以依据相关法律法规和人事管理制度，解除与该员工的人事关系。但在此之前，单位需提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资。
经济补偿：
- 解除聘用合同前，单位需按员工在本单位工作的年限支付经济补偿金，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。这是单位在解除聘用合同时应承担的法律责任。
三、可能被开除的特定情形
严重违反规章制度：
- 若员工在病假期间存在严重违反单位规章制度的行为，如通过不正当手段获取虚假证明来请长期病假，单位有权依据规定对该员工进行纪律处分，直至开除。这是单位维护正常管理秩序的必要手段。
符合聘用合同约定的解除条件：
- 若事业单位与员工签订的聘用合同中有关于特定情形下可以解除合同的明确约定，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，当这些约定情形出现时，单位可以按照合同约定辞退员工。这是合同自由原则的体现。
四、建议与总结
对于员工：
- 在病假期间，应遵守单位规章制度，如实提交病假申请材料，积极配合单位的管理。同时，也要关注自己的医疗期和能否继续工作的问题，以便在医疗期满后能够顺利回归工作岗位或做好后续安排。
对于单位：
- 在处理长期病假的员工时，必须严格遵守相关法律法规和单位规定，确保程序的合法性和正当性。同时，也要完善内部管理制度，明确病假申请流程、医疗期管理以及辞退条件等，以避免因操作不当而引发法律纠纷。
综上所述，事业编长期病假不一定会被开除，关键在于是否符合病假规定、是否处于医疗期内、医疗期满后能否从事原工作或单位另行安排的工作，以及是否存在违反单位规章制度的行为。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。