关于直肠穿孔切除20公分后私了赔偿自费部分费用五万是否合理的问题，这并没有一个绝对的答案，需要从多个角度进行综合考量：
医疗损害责任的角度：
- 首先，需要明确直肠穿孔是否属于医疗事故，以及医疗机构或医务人员在此过程中是否存在过错。如果确实存在过错，并且该过错与直肠穿孔有直接的因果关系，那么医疗机构应当承担相应的赔偿责任。
- 赔偿的范围通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费，以及因康复需要而支出的合理费用等。如果造成了残疾，还应当赔偿残疾生活辅助具费和残疾赔偿金。
- 在这个案例中，自费部分费用五万是否合理，需要看这些费用是否都属于上述赔偿范围内，并且是否与医疗损害有直接的关联。如果五万费用中包含了大量与医疗损害无关的费用，或者某些必要费用被遗漏，那么这个赔偿金额就可能不合理。
赔偿协商的角度：
- 私了赔偿通常是双方自愿协商的结果。在协商过程中，双方会考虑多种因素，如医疗损害的严重程度、患者的实际损失、医疗机构的承担能力等。
- 如果双方认为五万自费部分费用是一个合理的赔偿金额，并且能够达成一致意见，那么这个金额就是合理的。但是，如果一方认为这个金额过高或过低，并且无法与对方达成一致意见，那么就需要通过法律途径来解决争议。
法律程序与标准的角度：
- 如果双方无法就赔偿金额达成一致意见，患者可以选择通过法律途径来维护自己的权益。这通常包括向法院提起诉讼或申请医疗事故鉴定等。
- 在法律程序中，法院或鉴定机构会根据相关法律法规和行业标准来评估医疗损害的严重程度、患者的实际损失以及医疗机构的过错程度等因素，并据此作出公正的裁决。
- 因此，如果五万自费部分费用与法院或鉴定机构评估的赔偿金额相差较大，那么这个金额就可能不合理。
建议：
- 在处理此类医疗纠纷时，建议患者先与医疗机构进行协商，尝试达成一个双方都能接受的赔偿协议。
- 如果协商无果，患者可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以了解自己的权益和可能的赔偿范围。
- 在协商或诉讼过程中，患者应保留好所有与医疗损害相关的证据和资料，以便在需要时提供证明。
最后需要强调的是，每个医疗纠纷案件都有其独特性和复杂性，因此无法简单地给出一个“合理”或“不合理”的结论。如果您对此类问题有进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。