合同专用章不能算作单位公章，二者在功能、使用范围及法律效力上均存在显著差异。以下是对这一问题的详细解答：
一、定义与用途
公章：公章是单位处理内外部事务的官方印鉴，它代表着单位的整体意志和权威。在工商登记、出具证明文件、办理重要事务以及签署各类对外文件等场合，公章均发挥着不可或缺的作用。其法律效力全面且权威，是单位经营管理中不可或缺的法定印鉴。
合同专用章：合同专用章则是专为合同签订而设计的印章。它的使用范围相对特定，即仅限于合同签订及相关事务处理。合同专用章的设立，旨在提高合同管理的便捷性和效率，同时明确合同的法律主体和责任归属。
二、使用范围
公章：公章的使用范围广泛，适用于需以单位名义对外表态的重要文件，如政府公文、合作协议（非经济类）、人事任免通知等。它代表着单位的整体意志和决策，具有极高的法律效力。
合同专用章：合同专用章的使用范围则相对狭窄，仅限于经济类合同的签署，包括购销协议、服务合同、租赁合同等。它不得用于其他类型文件，以确保合同管理的规范性和有效性。
三、法律效力
公章：公章具有最高法定效力。其加盖行为视为单位对文件内容的全面认可，可引发行政、民事等多重法律后果。因此，在使用公章时，必须严格遵守相关法律法规和单位内部管理规定。
合同专用章：合同专用章仅在合同约定范围内产生效力。若合同内容超出授权范围或违反法律规定，可能面临无效风险。例如，某公司用合同专用章签署担保协议，因超越经营范围被认定无效。这说明了合同专用章在使用时必须严格遵守合同约定和法律规定。
四、管理规范
公章：公章实行严格审批制度，通常由法定代表人或授权高管保管。使用时需多级审批并登记备案，以确保公章使用的合规性和安全性。
合同专用章：合同专用章则由法务部门或业务部门专人管理。使用流程侧重合同合规性审查，需留存合同文本备查。这有助于确保合同管理的规范性和有效性，降低法律风险。
综上所述，合同专用章与公章在功能、使用范围及法律效力上均存在显著差异。因此，在实际操作中，必须根据具体事务的性质和需求选择合适的印章类型。这不仅关乎到事务处理的合规性和法律效力，更是对单位管理规范性的重要体现。