签署协议没按手印，在一般情况下是有效的，但具体效力还需根据协议内容、签订过程以及是否存在特殊约定等因素来综合判断。以下从多个角度为您详细分析：

一、协议生效的法律基础

1. 《民法典》的相关规定：

   • 根据《民法典》第四百六十九条，合同可以采用书面形式、口头形式或其他形式。书面形式包括合同书、信件等有形表现所载内容的形式，以及可随时调取查用的数据电文。这意味着，协议的成立并不依赖于特定的形式，只要能够有形地表现所载内容即可。
   • 《民法典》第五百零二条进一步规定，依法成立的合同，自成立时生效，除非法律另有规定或当事人另有约定。这表明，协议的生效主要取决于其是否依法成立，而非是否按手印。

2. 合同成立的核心要素：

   • 根据《民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这里明确指出了签名、盖章或按指印是合同成立的三种方式，但并未要求必须同时满足这三种方式。因此，只要签字真实反映当事人意思表示，即可认定合同成立，按手印并非必备条件。

二、影响协议效力的具体因素

1. 行为人具有相应的民事行为能力：

   • 签订协议的当事人必须是成年人，且精神状况正常，能够清晰认识自己行为的性质和后果。这是确保协议双方能够理解和承担协议所带来法律义务的基础。如果一方或双方不具备相应的民事行为能力，那么协议可能因主体不适格而无效。

2. 意思表示真实：

   • 当事人签订协议必须是其真实自愿的想法，不存在欺诈、胁迫等情形。如果协议是在欺诈、胁迫等不正当手段下签订的，那么受影响的一方有权请求撤销协议。因此，即使协议已经签字或盖章，但如果存在意思表示不真实的情形，协议的效力也可能受到影响。

3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：

   • 协议内容必须合法合规，不能是违法犯罪的约定，也不能违背社会公德和善良风俗。如果协议内容违反法律法规的强制性规定或公序良俗，那么协议可能因违法而无效。

4. 特别约定：

   • 如果协议中明确约定了必须双方签字并按手印才能生效，那么在这种情况下，只签字不按手印的协议可能无法生效。这是因为双方已经通过协议明确约定了生效条件，必须严格遵守。但这种特别约定并不常见，且需要双方在签订协议时明确约定。

三、实际案例分析

以房屋租赁合同为例，甲和乙签订了一份租赁合同，双方仅在合同上签字确认，没有按手印。后甲以合同没有按手印为由主张合同无效并拒绝履行。在此情况下，法院通常会认定该租赁合同有效，因为：

• 双方均具有相应的民事行为能力；
• 签订合同是双方真实意思的表示；
• 合同内容不违反法律法规的强制性规定和公序良俗；
• 签字作为合同成立的一种方式，已足够使合同生效。

四、建议

为避免可能出现的纠纷，建议您在签订重要协议时：

• 明确约定协议的生效条件：如果双方有特殊要求，如必须按手印才能生效，那么应在协议中明确约定。
• 确保协议内容合法合规：协议内容应符合法律法规的规定，不违背公序良俗。
• 保留好相关证据：如协议文本、签订过程中的沟通记录等，以便在发生纠纷时能够证明自己的权益。

如果您对协议的效力存在疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。