结论：在建设单位原因导致的窝工情况下，施工单位进行索赔时，规费和税金是否应计入索赔金额，需依据合同约定及具体索赔事项的性质来判断。以下从不同角度进行详细分析：
一、合同有明确约定的情况
合同约定包含规费和税金：
- 如果施工合同中明确规定了窝工索赔的范围包括规费和税金，或者合同中的计价方式已经隐含了这些费用在索赔中的计算，那么施工单位在索赔时，可以依据合同约定，将规费和税金计入索赔金额。
合同约定不包含规费和税金：
- 反之，如果合同中明确排除了规费和税金在窝工索赔中的计算，或者合同计价方式未考虑这些费用，那么施工单位在索赔时，通常无法将规费和税金计入索赔金额。
二、合同无明确约定的情况
依据行业惯例和公平原则：
- 在合同没有明确约定的情况下，可以参考行业惯例和公平原则来判断。规费和税金是施工单位在正常施工过程中必须承担的费用，如果因建设单位原因导致窝工，施工单位实际上并未减少这些费用的支出（如规费中的社会保险费、住房公积金等，税金中的增值税等），因此，从公平角度出发，施工单位有权要求建设单位补偿这部分费用。
依据实际损失和合理预见原则：
- 施工单位在索赔时，应证明窝工导致的实际损失，包括规费和税金的支出。同时，根据合理预见原则，建设单位在签订合同时应能预见到窝工可能导致的损失，包括规费和税金的增加。因此，在合同无明确约定的情况下，施工单位可以主张将规费和税金计入索赔金额。
三、具体索赔事项的性质
窝工导致的直接损失：
- 如果窝工直接导致了施工单位人员、设备的闲置，进而产生了额外的规费和税金支出（如因闲置人员仍需缴纳社会保险费等），那么这部分费用应作为直接损失计入索赔金额。
窝工导致的间接损失：
- 如果窝工导致的规费和税金支出是间接的，如因窝工影响了施工进度，进而导致了整个项目的延期，从而增加了税金等费用，那么这部分费用的索赔可能更为复杂，需要综合考虑合同约定、行业惯例、公平原则以及实际损失等因素。
四、实际操作建议
仔细审查合同条款：
- 施工单位在索赔前，应仔细审查施工合同中的相关条款，特别是关于窝工索赔的范围、计价方式等，以确定规费和税金是否应计入索赔金额。
收集证据证明损失：
- 施工单位应收集充分的证据证明窝工导致的实际损失，包括规费和税金的支出凭证、窝工期间的人员、设备闲置情况等。
与建设单位协商或寻求法律途径：
- 如果双方对索赔金额存在争议，施工单位可以与建设单位进行协商，寻求达成一致意见。如果协商无果，施工单位可以依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自己的合法权益。
总结：在建设单位原因导致的窝工情况下，施工单位进行索赔时，规费和税金是否应计入索赔金额，需综合考虑合同约定、行业惯例、公平原则以及实际损失等因素。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。