结论：新成立的合资公司能否与控股股东联合体投标，需根据具体情况判断，主要涉及关联关系处理、招标文件要求及法律法规限制等方面。以下从不同角度详细分析：
一、关联关系与公平竞争原则
关联关系定义：
- 根据《公司法》及相关规定，关联关系通常指公司控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员与其直接或者间接控制的企业之间的关系，以及可能导致公司利益转移的其他关系。
- 在此场景下，新成立的合资公司与控股股东之间很可能构成关联关系。
公平竞争原则：
- 招标投标活动应遵循公平、公正、公开和诚实信用的原则。
- 如果合资公司与控股股东联合体投标，可能引发对其他投标人的不公平竞争担忧，尤其是当控股股东在招标过程中具有较大影响力时。
二、招标文件的具体要求
招标文件规定：
- 招标文件通常会明确规定投标人的资格条件、投标联合体的组成要求等。
- 如果招标文件明确禁止或限制关联关系的投标人组成联合体投标，那么合资公司与控股股东联合体投标将不被允许。
特殊情况处理：
- 即使招标文件未明确禁止，但如果合资公司与控股股东联合体投标可能损害招标项目的公平性和竞争性，招标人也有权拒绝其投标。
三、法律法规的限制
反不正当竞争法：
- 根据《反不正当竞争法》，经营者不得采用财物或者其他手段进行贿赂以销售或者购买商品，或者利用职权或者影响力影响交易的单位或者个人，以谋取交易机会或者竞争优势。
- 如果合资公司与控股股东联合体投标被视为利用关联关系谋取不正当利益，可能违反该法规定。
招标投标法实施条例：
- 根据《招标投标法实施条例》，与招标人存在利害关系可能影响招标公正性的法人、其他组织或者个人，不得参加投标。
- 虽然该条例未直接提及合资公司与控股股东的关系，但如果这种关系被认为可能影响招标公正性，那么合资公司可能不得与控股股东联合体投标。
四、实际操作建议
审查招标文件：
- 在决定是否与控股股东联合体投标前，应仔细审查招标文件，了解其对投标人资格、联合体组成等方面的具体要求。
评估关联关系影响：
- 评估合资公司与控股股东之间的关联关系是否可能对招标项目的公平性和竞争性产生不利影响。
咨询专业意见：
- 在涉及复杂法律关系或不确定情况时，建议咨询专业律师或招标代理机构，以获取更准确的法律意见和操作建议。
总结与启示：新成立的合资公司能否与控股股东联合体投标，并非一个简单的“是”或“否”的问题。它取决于多种因素，包括关联关系的性质、招标文件的具体要求、法律法规的限制以及实际操作中的公平性和竞争性考虑。因此，在做出决策前，应进行全面、细致的评估和咨询。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。