针对您提出的“农用拖拉机进市区被追尾怎么处理”这一问题，我会从几个方面为您详细解答。
首先，关于农用拖拉机进入市区的合法性，根据《中华人民共和国道路交通安全法》以及各地方的具体交通管理政策，拖拉机作为机动车的一种，通常是不被允许随意进入市区或特定禁止通行的区域的。如果确实需要因特殊作业需求（如农业生产、市政施工等）进入市区，应提前向相关部门申请通行证或许可证，并严格按照指定的路线和时间行驶。
接下来，针对您被追尾的情况，处理步骤如下：
确保安全：
- 在发生事故后，首先确保自己和对方的安全，如果可能的话，将车辆移至不妨碍交通的地方。
- 开启危险报警闪光灯，并在车辆后方设置警示标志，以提醒其他车辆注意。
报警并等待交警：
- 立即拨打当地的交通事故报警电话，报告事故发生的时间、地点、车辆类型、人员伤亡情况等信息。
- 等待交警到场处理，不要擅自离开事故现场。
配合交警调查：
- 向交警如实陈述事故发生的经过，提供自己的驾驶证、行驶证等相关证件。
- 如果拖拉机是因特殊作业需求进入市区且持有通行证，应向交警出示相关证明。
- 配合交警进行现场勘查、拍照取证等工作。
处理事故责任：
- 交警会根据事故现场勘查、证人证言、车辆痕迹等证据，确定事故责任。
- 如果拖拉机因违反交通管理规定进入市区而被追尾，虽然追尾车辆可能负有一定责任，但拖拉机驾驶员也可能因违规行驶而承担部分责任。
- 具体责任划分需根据交警的认定结果来确定。
后续处理：
- 根据交警的事故责任认定书，双方可以协商赔偿事宜。如果协商不成，可以通过法律途径解决。
- 如果拖拉机被扣留或需要接受其他处罚，应按照交警的要求及时处理，并缴纳相应的罚款。
最后，我想提醒您的是，为了避免类似事故的发生，拖拉机驾驶员应严格遵守交通管理规定，不要随意进入禁止通行的区域。如果确实需要进入市区，应提前了解当地的交通管理政策，并申请相应的通行证或许可证。同时，在行驶过程中要严格遵守交通规则，确保行车安全。