股东催缴出资通知书发出后，公司应按照以下步骤处理，确保程序合法且有效维护公司权益：

1. 确认通知书内容与送达有效性

   • 内容合规性：通知书需明确载明股东姓名、未出资或未足额出资的金额、出资期限（如章程约定或法定期限）、逾期出资的法律后果（如违约金、利息、股权受限等），并引用《公司法》第28条、第83条等依据。
     
   • 送达方式：优先选择书面形式（如EMS邮寄、公证送达），保留签收凭证；若股东拒收，可通过公告（需符合章程或法律规定）或电子方式（如邮件、短信）补充送达，确保程序无瑕疵。

2. 设定合理宽限期并跟进

   • 宽限期约定：在通知书中可给予股东合理期限（如15-30日）履行出资义务，避免直接认定违约导致纠纷升级。
     
   • 跟进措施：宽限期届满后，若股东仍未出资，公司应立即启动下一步程序，避免拖延丧失权利。

3. 依法追究违约责任

   • 违约金与利息：若章程或出资协议约定了逾期出资的违约金或利息，公司可要求股东支付；若无约定，可依据《民法典》第577条主张实际损失（如资金占用成本）。
     
   • 股权限制或除名：
     
     • 股权限制：根据《公司法解释三》第16条，公司可对未出资股东的利润分配请求权、新股优先认购权等权利作出合理限制。
       
     • 股东除名：若股东完全未履行出资义务且经催告后仍不缴纳，公司可召开股东会决议解除其股东资格（《公司法解释三》第17条），但需注意程序合法性（如通知未出资股东参会、避免损害债权人利益）。

4. 启动法律程序（如必要）

   • 民事诉讼：向法院起诉要求股东履行出资义务，并可申请财产保全防止其转移资产。
     
   • 刑事报案（极端情况）：若股东虚假出资或抽逃出资数额巨大、后果严重，可能构成《刑法》第159条的虚假出资罪，公司可向公安机关报案。

5. 更新公司登记与内部文件

   • 工商变更登记：若股东出资到位或股权结构变化，需及时办理工商变更登记，确保对外公示信息准确。
     
   • 内部文件修订：更新股东名册、公司章程等内部文件，明确股东权利义务。

风险提示：

• 催缴程序需严格遵循法律与章程规定，否则可能被股东主张程序违法而无效。
  
• 若公司存在瑕疵出资（如未依法验资），可能影响对股东的追责效力。
  
• 涉及国有股东或外资股东时，需额外遵守相关特殊规定（如国资监管、外资审批）。

如有具体案件细节（如出资方式、章程约定、股东抗辩理由等），可进一步向我咨询，我会结合实际情况提供针对性方案。