在原告将两个案子合并起诉被告的情况下，被告确实可以针对每个案子分别提出反诉，但需满足反诉的法定条件。以下是对此问题的详细分析：

1. 反诉的基本概念：

   • 反诉是指在已经开始的诉讼程序中，被告向本诉的原告提出的一种独立的反请求。它旨在通过抵消、吞并或排斥原告的诉讼请求，达到维护自身权益的目的。

2. 反诉的提出条件：

   • 反诉与本诉的关联性：反诉必须与本诉基于相同的法律关系或事实，或者反诉与本诉的诉讼请求之间存在因果关系。这是反诉成立的基本前提。
   • 反诉的独立性：反诉是一个独立的诉讼请求，它不受本诉诉讼请求的限制或影响。被告可以独立地提出反诉，并要求法院对反诉进行审理和判决。
   • 反诉的提出时机：反诉通常需要在本诉的答辩期间内提出，以确保诉讼程序的顺利进行和法院对案件的全面审理。

3. 针对两个案子的反诉：

   • 如果原告将两个独立的案子合并起诉被告，且这两个案子之间不存在直接的关联或相互影响，那么被告可以针对每个案子分别提出反诉。
   • 每个反诉都应满足上述反诉的提出条件，即与对应的本诉具有关联性、独立性，并在适当的时机提出。

4. 实际操作中的注意事项：

   • 明确反诉的请求和事实依据：被告在提出反诉时，应明确反诉的请求和事实依据，以便法院对反诉进行审理和判决。
   • 遵守诉讼程序：被告应遵守诉讼程序的规定，如反诉的提出时机、反诉状的提交等，以确保反诉的有效性。
   • 考虑反诉的合理性：被告在提出反诉前，应评估反诉的合理性和可行性，避免提出无意义的或无法成立的反诉，从而浪费诉讼资源和时间。

5. 法律后果：

   • 如果被告提出的反诉符合法定条件，法院将受理反诉，并与本诉合并审理。这将有助于法院全面、公正地处理案件，维护当事人的合法权益。
   • 如果反诉不符合法定条件，法院将不予受理或驳回反诉。被告需要承担因提出无效反诉而可能产生的诉讼费用和其他不利后果。

总结来说，在原告将两个案子合并起诉被告的情况下，被告可以针对每个案子分别提出反诉，但需确保每个反诉都满足反诉的法定条件。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。