结论前置：

1. 通常情况下，旷工一天扣三天工资的做法是不合法的，因为它违反了《劳动法》及相关法规中关于不得无故克扣或拖欠劳动者工资的规定。
2. 但在特定情况下，如果企业规章制度或劳动合同中有明确且合理的规定，并经过了合法程序制定和公示，可能具有一定的合法性，但这种情况较为少见且需严格符合法律要求。

详细分析：

一、法律依据与劳动者权益

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这是保护劳动者劳动报酬权益的基本法律框架。旷工一天，劳动者仅当天未提供劳动，因此用人单位最多只能不支付当天的工资，而扣除三天工资的做法显然超出了合理范围，侵害了劳动者获取劳动报酬的权益。

二、企业规章制度的合法性

虽然企业有权根据自身情况制定管理制度或劳动合同来约定旷工的处理办法，但这些规定必须合法、合理，且不违反劳动法的原则和精神。如果企业的规章制度或劳动合同中明确规定了旷工一天将扣3天工资，并且这一规定经过了合法的程序制定和公示（如与工会或职工代表平等协商确定，并向劳动者明确公示告知），从形式上看似乎具有合法性。然而，这并不意味着所有类似的扣罚方式都是合理的。司法实践中，如果扣罚方式被认为过度严厉，以至于构成对劳动者劳动报酬权利的侵犯，那么该规定可能被视为不合法。

三、经济损失与赔偿

如果劳动者旷工的行为给用人单位造成了实际经济损失，用人单位可以要求劳动者赔偿损失。但这种赔偿应当基于实际损失的合理计算，并提供相应的证据支持，而不是简单地以扣三天工资这种明显不合理的方式进行。根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失，且每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。

四、合法合理的处理方式

对于劳动者的旷工行为，用人单位应当依据公司的规章制度或劳动合同约定进行处理。处理方式可以包括给予警告、记过、扣减绩效考核分数、扣减奖金等，但这些处理方式都应当在合法、合理、公正的范围内进行，不能违反国家法律法规的规定。例如，可以规定旷工一天扣当天工资，或者根据旷工天数和情节严重程度给予相应的纪律处分，但不应直接扣除多倍工资。

五、劳动者的维权途径

如果劳动者认为用人单位的处理方式不合法或不合理，可以与用人单位协商解决。协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，还可以依法提起诉讼。

综合建议：

• 用人单位：在制定规章制度时，应确保其内容符合法律法规的要求，避免过度惩罚员工。处理员工旷工问题时，应遵循合法、合理、公正的原则，并尊重劳动者的合法权益。
• 劳动者：在遇到不合理的克扣工资行为时，应首先与用人单位协商解决。协商不成时，及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

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