祖坟被高铁征用，赔偿款的归属需根据具体情况判断，一般可能归集体或归坟主后代所有。以下从不同角度进行分析：
一、赔偿款归属集体的情况
土地所有权归属集体：
- 如果祖坟所在的土地属于集体所有，且坟主后代没有合法的土地使用权或坟墓管理权证明，那么在土地被征用时，赔偿款通常归集体所有。这是因为集体作为土地的所有者，有权获得因土地征用而产生的补偿。
坟墓管理责任在集体：
- 在某些地区，坟墓的管理责任可能由集体承担，特别是当坟墓位于集体所有的土地上，且坟主后代长期未进行管理或维护时。在这种情况下，如果坟墓因征用需要迁移或拆除，赔偿款也可能归集体所有，用于坟墓的迁移、重建或补偿集体因管理坟墓而产生的费用。
二、赔偿款归属坟主后代的情况
坟主后代拥有合法权利：
- 如果坟主后代能够证明对坟墓拥有合法的使用权或管理权，例如通过土地使用证、坟墓管理协议等文件，那么在坟墓被征用时，赔偿款应归坟主后代所有。这是因为坟主后代作为坟墓的合法使用者或管理者，有权获得因坟墓被征用而产生的补偿。
坟墓具有特殊文化或历史价值：
- 如果坟墓具有特殊的文化或历史价值，例如属于文物保护单位或具有地方特色的传统坟墓，那么在征用过程中，可能会给予坟主后代更高的补偿。在这种情况下，赔偿款的归属也可能更倾向于坟主后代，以体现对文化遗产的保护和尊重。
三、实际操作中的建议
收集证据：
- 坟主后代应尽可能收集与坟墓相关的证据，如土地使用证、坟墓管理协议、照片、视频等，以证明对坟墓拥有合法的使用权或管理权。
与集体协商：
- 在征用过程中，坟主后代应与集体进行充分协商，明确赔偿款的归属和分配方式。如果双方无法达成一致意见，可以寻求当地政府或相关部门的调解或仲裁。
寻求法律援助：
- 如果坟主后代与集体在赔偿款归属问题上存在争议，且无法通过协商解决，可以寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
总结来说，祖坟被高铁征用时，赔偿款的归属需根据土地所有权、坟墓管理责任以及坟主后代是否拥有合法权利等因素进行综合判断。在实际操作中，建议坟主后代收集相关证据，与集体进行充分协商，并在必要时寻求法律援助。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。