结论：签了补偿协议后，离职证明上写“个人原因”通常不会影响协议中补偿金的发放，但具体能否获得及金额多少需结合法律规定、补偿协议内容以及实际情况综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、经济补偿金的一般规定与离职原因的关系
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在特定情形下需要向劳动者支付经济补偿金，这些情形包括用人单位与劳动者协商一致解除劳动合同、劳动者因用人单位存在过错而解除劳动合同、用人单位依法进行经济性裁员等。在这些情形下，离职原因并非决定经济补偿金发放的唯一因素，而是需要综合考虑劳动合同解除的具体原因、双方协商的结果以及法律规定。
二、“个人原因”离职对经济补偿金的具体影响
一般情况：
- 如果劳动者因个人原因主动提出辞职，且不存在用人单位的过错行为，那么通常情况下，劳动者是无权要求用人单位支付经济补偿金的。这是因为经济补偿金的设立初衷是为了弥补劳动者因非本人意愿失去工作所遭受的经济损失。
- 然而，如果双方已经签订了补偿协议，且协议中明确约定了补偿金的发放条件和金额，那么离职证明上写“个人原因”通常不会影响补偿金的发放，因为补偿协议已经对双方的权利义务进行了明确约定。
特殊情况：
- 虽然劳动者以“个人原因”离职是主动行为，但如果能够证明用人单位存在过错（如拖欠工资、未缴纳社会保险等），或者双方协商一致解除劳动合同并约定了经济补偿金，那么劳动者仍然有权要求用人单位支付相应的经济补偿金。
- 在这种情况下，即使离职证明上写的是“个人原因”，劳动者也可以依据补偿协议和用人单位的过错行为，向用人单位主张经济补偿金。
三、实际操作建议
审查补偿协议：
- 劳动者在签订补偿协议时，应仔细审查协议内容，确保协议中明确约定了补偿金的发放条件、金额以及支付方式等关键条款。
- 如果协议中有任何不明确或模糊的地方，应及时与用人单位沟通协商，确保自己的权益得到充分保障。
保留相关证据：
- 劳动者在离职过程中，应保留好与用人单位签订的劳动合同、补偿协议、工资单、社保缴纳记录等相关证据。
- 这些证据在后续主张经济补偿金时，将起到至关重要的作用。
及时沟通协商：
- 如果劳动者对离职证明上的离职原因有异议，或者认为用人单位存在过错行为，应及时与用人单位沟通协商。
- 通过沟通协商，双方可以达成一致意见，避免不必要的法律纠纷。
寻求法律帮助：
- 如果劳动者与用人单位在补偿金发放问题上无法达成一致意见，或者认为自己的权益受到侵害，可以寻求法律帮助。
- 作为专业律师，我可以根据具体情况为劳动者提供法律咨询和法律援助，帮助劳动者维护自己的合法权益。
总结：签了补偿协议后，离职证明上写“个人原因”通常不会影响协议中补偿金的发放。但劳动者在离职过程中应仔细审查补偿协议内容、保留相关证据、及时沟通协商，并在必要时寻求法律帮助，以确保自己的权益得到充分保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。