结论：一般情况下，交警在当事人连续闯红灯三年后才立案查处是不太合理的，但具体是否可行需结合实际情况判断。
分析如下：
从行政处罚的时效性角度：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条：“违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。” 闯红灯属于交通违法行为，通常不涉及公民生命健康安全或金融安全且无严重危害后果，因此其行政处罚的时效一般为二年。
- 在本案例中，当事人连续闯红灯的行为若在三年后才被交警立案查处，从时效性角度来看，已经超过了通常的二年处罚时效，除非该行为涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果，或者法律另有特别规定。
从证据收集与保存的角度：
- 交通违法行为的查处往往依赖于现场证据或电子监控设备记录的证据。随着时间的推移，这些证据可能会因为各种原因（如设备故障、数据丢失等）而难以获取或保存。
- 如果交警在三年后才立案查处，他们需要确保有充分的证据来证明当事人的违法行为，这在实际操作中可能会面临很大的困难。
从法律程序与公平性的角度：
- 法律程序要求及时、公正地处理违法行为，以维护社会秩序和公平正义。如果交警长时间不立案查处，可能会给当事人造成一种“违法不受罚”的错觉，从而损害法律的权威性和公信力。
- 同时，对于其他遵守交通规则的公民来说，这种长时间不立案查处的行为也可能被视为不公平，因为他们一直在遵守规则，而违法者却长时间未受到应有的惩罚。
建议：
- 如果当事人确实存在连续闯红灯的违法行为，并且交警在三年后才立案查处，当事人可以首先了解交警立案查处的具体依据和证据情况。
- 如果当事人认为交警的立案查处行为存在不合理之处，如超过了行政处罚的时效、证据不足等，可以向交警部门提出异议或申请行政复议。
- 在任何情况下，当事人都应该积极配合交警部门的调查和处理工作，同时也可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。
特殊情况说明：
- 如果当事人的闯红灯行为造成了严重的交通事故或人员伤亡等危害后果，那么即使超过了通常的二年处罚时效，交警部门也可能根据相关法律法规进行立案查处。
- 另外，如果法律对闯红灯等交通违法行为的处罚时效有特别规定（如延长至五年等），那么交警部门在三年后立案查处也可能是合法的。但这种情况需要具体查看相关法律法规的规定。
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