债务人死亡三年后，法院是否仍会划扣其遗产，这主要取决于遗产是否已被处理以及是否存在有效的债权申报和执行程序。以下从几个关键角度进行分析：

1. 遗产状态与执行时效：

   • 遗产未处理：如果债务人死亡后，其遗产尚未被分割或处理，且债权人在此期间内依法申报了债权，那么法院在查明债权属实且未超过诉讼时效的情况下，仍有权对遗产进行划扣以偿还债务。
   • 遗产已处理：若债务人死亡后，其遗产已经被分割或处理完毕，且债权人未能在法定期限内申报债权或提起诉讼，那么法院通常不会再对已处理的遗产进行划扣。但需注意，如果遗产处理过程中存在恶意转移、隐匿财产等违法行为，债权人仍可依法追索。

2. 诉讼时效与执行程序：

   • 诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。这意味着，债权人需要在知道或应当知道权利受到损害之日起三年内提起诉讼或申报债权，否则可能丧失胜诉权。然而，这一时效规定并不直接决定法院是否会划扣遗产，而是影响债权人能否通过法律途径获得救济。
   • 执行程序：即使债权人提起了诉讼并获得了胜诉判决，也需要通过执行程序来实现债权。如果债务人死亡后，其遗产足以清偿债务，且执行程序未因各种原因（如遗产争议、执行异议等）而中止或终结，那么法院在执行过程中仍会划扣遗产以偿还债务。

3. 特殊情况下的处理：

   • 遗产不足以清偿债务：如果债务人死亡后，其遗产不足以清偿全部债务，那么债权人只能按照法定顺序和比例受偿。在这种情况下，即使法院划扣了遗产，也可能无法完全满足债权人的诉求。
   • 遗产管理人制度：根据《民法典》的规定，债务人死亡后，其遗产可能由遗产管理人进行管理。遗产管理人有责任清理遗产并处理债权债务关系。如果遗产管理人未能妥善履行职责，导致债权人权益受损，债权人可以依法追究其责任。

法律建议：

• 如果您是债权人，且债务人已经死亡，建议您尽快向法院申报债权并提起诉讼（如果尚未超过诉讼时效）。同时，关注债务人遗产的处理情况，确保您的债权能够得到及时、有效的清偿。
• 如果您是债务人的继承人或遗产管理人，且面临债权人的债权申报和诉讼，建议您积极配合法院的调查和执行工作，确保遗产处理的合法性和公正性。同时，也可以咨询专业律师以了解您的权利和义务。

总结来说，债务人死亡三年后，法院是否仍会划扣其遗产取决于多种因素，包括遗产状态、诉讼时效、执行程序以及特殊情况下的处理等。如果您面临此类问题，建议直接向我咨询以获取更具体、更专业的法律建议。