电动车在禁行区行驶的处罚方式主要依据地方性法规，通常包括罚款、扣车、教育整改等措施，具体处罚需结合违规情节和地方规定确定。以下是详细分析：

1. 罚款
   这是最常见的处罚方式。根据《道路交通安全法》及地方实施条例，电动车违反禁行规定通常会被处以20元至200元罚款。例如：

   • 北京市规定：非机动车进入禁行区域，罚款20元；
     
   • 深圳市规定：电动车在限行路段行驶，罚款200元。
     关键点：罚款金额因城市而异，需以当地交管部门公告为准。

2. 扣车或暂扣证件
   若电动车属于超标车（如时速超过25km/h、无脚踏骑行功能等），或驾驶人存在无证驾驶、伪造号牌等行为，可能面临：

   • 扣留车辆直至整改合格；
     
   • 暂扣驾驶证（如持有摩托车驾照但驾驶超标电动车）。
     法律依据：根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》，交管部门可对存在安全隐患的车辆采取强制措施。

3. 教育整改
   部分城市会要求违规者参加交通安全教育课程或签署承诺书，例如：

   • 上海市对首次违规的电动车驾驶人，可要求其通过“交通安全教育平台”学习并考试；
     
   • 广州市对违规外卖骑手，需完成3小时现场交通安全培训。
     目的：通过柔性执法强化安全意识。

4. 特殊情形加重处罚
   若违规行为伴随其他违法行为（如闯红灯、逆行、载人超标等），可能面临叠加处罚。例如：

   • 电动车在禁行区逆行且未戴头盔，可能被合并处罚罚款+扣车；
     
   • 驾驶拼装、改装电动车进入禁行区，可能被强制报废车辆。

建议：

• 出行前通过当地交管部门官网或APP查询禁行区域；
  
• 若已违规，尽快处理罚款（逾期可能产生滞纳金）；
  
• 对处罚有异议的，可申请行政复议或提起行政诉讼。
  

如有具体城市或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合地方规定为您分析。