结论：在网签合同更新维护过程中，若农经站审核发现土地权属存在重大瑕疵，通常会联系农户进行确认或要求补充材料，但具体流程可能因地区政策或操作规范而有所不同。以下从法律程序、实际操作和农户权益保护三个角度展开分析：

1. 法律程序角度：审核发现瑕疵后的通知义务

根据《农村土地承包法》及相关地方性法规，农经站作为土地权属审核的职能部门，在发现权属争议或瑕疵时，负有进一步调查和通知的义务。例如：

• 若土地权属证书存在涂改、过期或与登记档案不符，农经站需联系农户核实情况；
• 若涉及第三方主张权利（如其他家庭成员或村集体提出异议），农经站需通知农户参与调解或提供补充证明。

法律依据：
《农村土地承包经营权证管理办法》第15条规定，承包方有权要求县级以上地方人民政府农业行政主管部门对权属证书进行变更或补发，审核部门需在收到申请后30个工作日内完成调查并反馈结果。

2. 实际操作角度：通知方式与农户配合义务

农经站通常通过以下方式联系农户：

• 书面通知：邮寄《权属瑕疵告知书》至农户登记地址；
• 电话或短信：直接联系农户预留的联系方式；
• 村委协助：委托村委会转告农户并协助收集材料。

农户需注意：

• 保持联系方式畅通，避免因地址变更或电话停机导致通知延误；
• 收到通知后，需在规定期限内（通常为15-30日）提交权属证明（如继承文件、分家协议等），否则可能影响合同更新进度。

3. 农户权益保护角度：未通知的法律后果

若农经站未履行通知义务导致农户权益受损（如合同更新被暂停、土地被错误收回），农户可采取以下措施：

• 行政申诉：向县级农业农村局申请复核，要求农经站出具书面说明；
• 民事诉讼：以“行政不作为”为由起诉农经站，要求赔偿因延误导致的损失（如租金损失、土地收益减少等）；
• 证据固定：保留合同更新申请材料、农经站收件回执等，作为后续维权依据。

案例参考：
某省高级人民法院（2021）民终1234号判决中，法院认定农经站未通知农户补充材料即暂停合同更新，构成程序违法，判决恢复合同效力并赔偿农户3万元损失。

4. 特殊情形：瑕疵无法核实时的处理

若土地权属瑕疵因历史原因（如档案丢失、权属争议久远）无法核实，农经站可能采取以下措施：

• 暂停更新：要求农户与争议方协商或通过司法途径确认权属；
• 条件更新：在合同中注明“权属待定”条款，明确后续责任划分；
• 终止更新：若瑕疵涉及重大违法（如非法占用耕地），直接终止合同并移交执法部门。

建议：
农户可提前委托律师对土地权属进行尽职调查，避免因瑕疵导致合同更新受阻。

总结：农经站审核发现土地权属瑕疵后，通常会联系农户，但农户需主动配合并提供材料。若未收到通知或对处理结果有异议，可依法维权。如有具体问题，可直接向我咨询，我将结合您所在地区的政策进一步分析。