结论：别人用你的店注册公司是否违法，取决于具体情形。若过程合法合规，则不违法；但若存在违法情形，如未经授权、使用虚假材料或从事非法活动等，则将面临法律制裁。以下是对此问题的详细分析：
合法情形
获得明确授权：
- 如果他人获得了你的明确授权，比如通过签署授权委托书，允许其使用你的店铺地址作为公司注册地址，并且这一行为符合当地工商行政管理部门的规定，那么这种行为是合法的。
材料真实有效：
- 提交的注册材料，包括身份证明、地址证明等，必须真实、合法、有效。如果使用的材料都是真实的，且符合注册要求，那么使用你的店铺地址注册公司就是合法的。
遵循注册流程：
- 严格按照当地工商行政管理部门规定的公司注册流程操作，包括按时提交文件、缴纳费用等步骤。如果整个注册过程都遵循了法律法规，那么使用你的店铺地址注册公司就是合法的。
违法情形及法律后果
未经授权使用：
- 如果他人未经你的授权，擅自使用你的店铺地址作为公司注册地址，这可能构成侵权。你有权要求对方停止侵权行为，并可能寻求法律赔偿。
使用虚假材料：
- 根据《中华人民共和国市场主体登记管理条例》第四十四条，如果提交虚假材料或采取欺诈手段隐瞒重要事实取得市场主体登记的，将被责令改正，没收违法所得，并处以罚款；情节严重的，还可能吊销营业执照。
从事非法活动：
- 如果注册公司的目的是为了进行洗钱、诈骗、非法集资等违法犯罪活动，那么帮忙注册的人可能会被认定为共犯，需承担相应的刑事责任。
建议与警示
谨慎授权：
- 在授权他人使用你的店铺地址注册公司前，务必了解对方的身份和目的，确保对方是合法合规的。同时，签署明确的授权委托书，规定双方的权利和义务。
审查材料：
- 如果他人使用你的店铺地址注册公司，你有权要求对方提供真实的注册材料，并进行仔细审查。确保所有材料都是真实、合法、有效的。
了解注册流程：
- 了解当地工商行政管理部门规定的公司注册流程，确保整个注册过程都符合法律法规要求。如果可能的话，可以陪同对方一起办理注册手续。
及时咨询：
- 如果你对他人使用你的店铺地址注册公司有任何疑虑或担忧，可以及时向我咨询。我会根据你的具体情况，提供专业的法律意见和建议。
总结：别人用你的店注册公司是否违法，取决于是否获得了你的明确授权、是否使用了真实有效的材料以及是否遵循了注册流程。为了确保自己的权益不受侵害，建议你谨慎授权、审查材料、了解注册流程，并在有疑虑时及时咨询专业律师。