不是夫妻也可以做羊水亲子鉴定，但需满足一定条件并遵循特定程序。以下从法律和实务角度为你详细分析：

1. 法律层面：无婚姻关系限制，但需尊重胎儿权益
   我国法律未禁止非夫妻关系者进行亲子鉴定，但需注意：

   • 若胎儿尚未出生，鉴定需以保护胎儿权益为前提。根据《民法典》第16条，涉及胎儿利益保护的（如继承、接受赠与等），胎儿视为具有民事权利能力。羊水穿刺属于有创检查，可能对胎儿健康造成风险，因此需严格评估必要性。
     
   • 若鉴定目的涉及抚养权、继承权等法律纠纷，法院可能根据《民事诉讼法》第76条委托鉴定机构进行，此时无需夫妻关系，但需符合“必要证据”标准（如一方否认亲子关系且其他证据不足）。

2. 实务操作：需所有相关方同意并履行手续

   • 同意程序：羊水亲子鉴定需孕妇书面同意（因穿刺需经孕妇身体），若胎儿生父参与，也需其同意。若孕妇无民事行为能力（如昏迷），需由法定代理人（如父母）代为同意。
     
   • 机构资质：必须选择司法部认证的亲子鉴定机构（如司法鉴定所），确保鉴定报告具有法律效力。非法机构出具的报告可能被法院排除。
     
   • 隐私保护：鉴定机构有义务对委托人信息保密，但若涉及诉讼，鉴定报告可能作为证据提交法院，此时相关方有权查阅。

3. 风险提示：需权衡利弊

   • 健康风险：羊水穿刺可能导致流产、感染等并发症（概率约0.5%-1%），需在正规医院由专业医生操作。
     
   • 法律后果：若鉴定结果否定亲子关系，非婚生子女仍享有与婚生子女同等的抚养费、继承权（《民法典》第1071条、第1127条），委托人需承担相应法律责任。

建议：若你考虑进行羊水亲子鉴定，建议先咨询专业律师评估必要性及风险，再联系正规鉴定机构。如有具体纠纷（如抚养费争议），可进一步向我说明情况，我会为你分析法律策略。