结论：父亲帮患精神疾病的儿子办理个体营业执照本身并不违规，但关键在于儿子是否具备完全民事行为能力以及父亲是否在合法范围内行使代理权。

分析说明：

1. 关于民事行为能力：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，个体工商户的设立者应当具备完全民事行为能力。如果儿子患有精神疾病且被认定为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，那么他本人是无法直接办理个体营业执照的。
   • 在这种情况下，如果父亲作为儿子的法定监护人，为了儿子的利益（如经营以维持生计或治疗等），在符合法律法规和儿子利益的前提下，可以代为办理相关手续。但这一行为必须严格遵循法律程序，确保儿子的权益不受损害。

2. 关于代理权的行使：

   • 父亲作为儿子的法定代理人或监护人，在代为办理个体营业执照时，必须明确代理权限和范围，并遵守相关法律法规。
   • 代理行为应当合法、合规，不得损害被代理人的利益。例如，父亲不得利用儿子的名义进行违法经营活动或损害儿子财产权益的行为。

3. 实际操作中的注意事项：

   • 在办理个体营业执照前，建议先对儿子的民事行为能力进行评估或确认。如果儿子被认定为无民事行为能力人或限制民事行为能力人，需要依法指定监护人并办理相关手续。
   • 父亲在代为办理时，应提供必要的证明文件（如儿子的身份证明、监护关系证明等），并按照工商行政管理部门的要求填写相关表格和提交材料。
   • 办理过程中应遵守诚实信用原则，如实提供信息并配合相关部门的审查工作。

特殊场景：

• 如果儿子虽然患有精神疾病，但并未被完全剥夺民事行为能力（即属于限制民事行为能力人），且他本人有意愿并具备一定能力参与经营活动，那么父亲可以在尊重儿子意愿的前提下，协助其办理个体营业执照，并在经营过程中给予必要的指导和监督。

后续行动建议：

• 在办理个体营业执照前，建议先咨询当地工商行政管理部门或法律专业人士，了解具体的办理流程和要求。
• 如果对儿子的民事行为能力有疑问或需要确认，可以寻求专业医疗机构的评估或法律程序的认定。
• 在办理过程中遇到任何问题或困难，可以随时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。