关于“还完本金后减免协议是否会被拒绝”的问题，结论并非绝对，需分情况讨论：

1. 减免协议已明确约定且合法有效

   • 若双方在减免协议中已明确约定“债务人还清本金后，债权人同意减免剩余利息/违约金等”，且该协议不存在《民法典》规定的无效情形（如欺诈、胁迫、恶意串通损害他人利益等），则减免协议具有法律效力。此时，债务人还清本金后，债权人无权单方面拒绝履行减免义务。
   • 法律依据：根据《民法典》第五百零九条，当事人应按约定全面履行义务；第五百七十七条，违约方需承担继续履行、赔偿损失等责任。若债权人拒绝减免，债务人可凭协议起诉要求履行。

2. 减免协议未明确约定或存在争议

   • 情况一：协议未明确减免条件
     若减免协议仅笼统约定“债权人可视情况减免”，但未明确“还清本金”为减免前提，则债权人可能以“未达成减免条件”为由拒绝。此时需结合协议目的、交易习惯等解释条款（参考《民法典》第一百四十二条）。
   • 情况二：债权人主张协议无效或可撤销
     若债权人能证明减免协议存在重大误解、显失公平（如利息过高导致减免后仍高于法定上限）等情形，可能依据《民法典》第一百四十七条至第一百五十一条请求撤销协议，从而拒绝减免。
   • 情况三：债务人存在违约行为
     若减免协议约定“债务人需按时还清本金且无其他违约行为”，但债务人实际存在逾期还款、提供虚假信息等行为，债权人可能依据协议条款拒绝减免。

3. 实务建议

   • 对债务人：
     
     • 签订减免协议时，务必明确约定“还清本金后，债权人同意减免XX金额/比例”，并留存转账记录、协议原件等证据。
       
     • 若债权人拒绝履行，可先协商并录音取证，协商无果后及时起诉（诉讼时效为3年，自约定减免期限届满起算）。
   • 对债权人：
     
     • 若需拒绝减免，应审查协议条款是否留有“拒绝权”（如“债权人有权根据债务人信用状况决定是否减免”），并确保拒绝理由符合法律规定（如债务人未履行附随义务）。
       
     • 避免以“内部审批未通过”等理由拒绝，否则可能构成违约。

总结：减免协议是否被拒绝，核心取决于协议条款的明确性及双方履约情况。建议签订协议时细化条款，并保留履约证据以降低风险。如有具体协议文本或纠纷细节，可进一步向我咨询，我会结合条款内容为您分析。