电动摩托车停放在小区公共停车位是否违法，需分情况讨论：
若小区公共停车位明确为机动车停车位：
- 法律依据：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，非机动车（包括电动摩托车）应当在规定地点停放，未设停放地点的，非机动车停放不得妨碍其他车辆和行人通行。同时，该法也明确了机动车停车位的专用性，即这些停车位是专为机动车设计的。
- 违法性分析：电动摩托车作为非机动车，停放在专为机动车规划的停车位上，属于违规行为。这不仅占用了机动车的停车资源，还可能因尺寸、重量不匹配造成停车位损坏或安全隐患。此外，这种行为还可能增加交通事故的风险，扰乱小区内的交通秩序。
- 法律后果：若电动摩托车违规停放在机动车停车位上，管理人员有权进行劝阻并要求立即驶离。若车主不在现场或拒绝驶离，且妨碍了其他车辆、行人的通行，将面临二十元以上二百元以下的罚款，并可能被拖移至指定地点。车主还需承担拖车费用及可能的停车场保管费用。
若小区公共停车位未明确区分机动车与非机动车停车位：
- 实际情况分析：在这种情况下，小区公共停车位可能被视为通用停车位，即机动车和非机动车均可停放。然而，这并不意味着电动摩托车可以随意停放。车主仍需遵守小区内的停车管理规定，确保停车行为不妨碍其他车辆和行人的通行。
- 建议做法：即使小区公共停车位未明确区分机动车与非机动车停车位，电动摩托车车主也应尽量寻找指定的非机动车停放区域进行停放。这些区域通常设有明确的标识和适宜的停车设施，能够更好地保障停车安全和他人的通行权益。
额外建议：
- 了解小区停车规定：在停放电动摩托车前，车主应先了解小区内的停车管理规定，确保自己的停车行为符合规定。
- 遵守交通法规：无论在哪里停放电动摩托车，车主都应严格遵守交通法规，确保停车行为不妨碍其他车辆和行人的通行。
- 积极沟通协商：若车主对小区内的停车管理规定有疑问或建议，可以积极与小区物业或相关部门进行沟通协商，共同维护良好的停车秩序。
总结：电动摩托车停放在小区公共停车位是否违法，取决于该停车位是否明确为机动车停车位。若明确为机动车停车位，则电动摩托车停放属于违规行为；若未明确区分，则车主仍需遵守小区内的停车管理规定和交通法规。为避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议电动摩托车车主尽量寻找指定的非机动车停放区域进行停放。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。