协议经过公证通常是具有法律效力的，但这并不意味着所有经过公证的协议都绝对有效，其有效性还受多种因素影响。以下从不同角度为您详细分析：
一、协议公证的有效情况
符合公证受理条件：
- 公证机构在受理公证申请时，会确保申请人与申请公证的事项有利害关系，当事人及利害关系人对公证事项无争议，且该事项属于公证机构的业务范围和执业区域内可受理的公证事项。若协议满足这些受理条件，通常能顺利完成公证流程，进而获得法律效力。
协议内容合法合规：
- 协议内容必须严格遵守法律法规的强制性规定，不得违背公序良俗。例如，一份房屋买卖合同，若内容明确双方的真实意思，包括房屋基本情况、价格、付款方式、交付时间等，且不违反房地产相关法律法规，那么这样的协议在公证后将具备法律效力。
公证程序合法：
- 公证机构及其公证员需按照法定程序进行公证，包括对当事人身份、资格和民事行为能力的审查，对协议内容的核实，制作谈话笔录，以及对公证过程的记录等。唯有公证程序合法，公证书方能具备相应的法律效力。
公证的法律效力体现：
- 证据效力：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，经过法定程序公证证明的法律事实和文书，人民法院应当作为认定事实的根据，但有相反证据足以推翻公证证明的除外。这意味着，在诉讼中，经过公证的协议具有较高的证明力。
- 强制执行效力：若协议中约定了债务人的给付义务，并且债务人明确表示愿意接受强制执行，那么当债务人不履行或履行不适当时，债权人可以直接向法院申请执行，无需再经过诉讼程序。这是公证协议的又一重要法律效力。
二、协议公证可能无效的情况
协议本身存在问题：
- 如协议内容违反法律、行政法规的强制性规定，或违背公序良俗，即使经过公证，也可能被认定为无效。例如，以违法交易为内容的协议，即便经过公证，也因其内容严重违法而自始无效。
公证过程存在瑕疵：
- 若公证机构或公证员在公证过程中存在严重违法行为，如未认真核实当事人身份、未对协议内容进行实质审查等，可能导致公证书的效力受到质疑。在这种情况下，当事人可通过法定程序申请撤销该公证书。
意思表示不真实：
- 如果一方当事人在受到欺诈、胁迫等情况下签订协议并进行公证，其真实意思表示受到影响。受损害方有权请求人民法院或仲裁机构撤销该协议，公证也会随之失去效力。
三、实际建议
- 签订协议前：确保协议内容合法合规，双方意思表示真实，且具备相应的民事行为能力。
- 公证过程中：选择正规的公证机构，配合公证员完成各项审查程序，确保公证过程的合法性和有效性。
- 公证后：妥善保管公证书，并在需要时及时出示以维护自己的合法权益。若发现公证书存在错误或瑕疵，应及时与公证机构联系并申请更正或撤销。
总结来说，协议经过公证通常具有法律效力，但具体效力还需根据协议内容、公证过程以及当事人的意思表示等因素综合判断。若您在协议公证方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。