针对您提出的“无固定期限的劳动合同员工因部门架构调整岗位撤销如何赔偿”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，无固定期限劳动合同的赔偿问题主要取决于辞退的原因、方式以及劳动者的月工资和工作年限。在您所描述的情境中，即部门架构调整导致岗位撤销，这通常属于劳动合同订立时的客观情况发生重大变化，且未能就变更劳动合同内容达成一致的情形。

一、合法辞退与经济补偿

1. 协商一致解除：

   • 如果用人单位与您能够协商一致解除劳动合同，那么用人单位需要按照您在本单位的工作年限支付经济补偿。具体标准为：每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。这里的月工资是指您在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

2. 法定情形提前通知解除：

   • 在部门架构调整导致岗位撤销的情况下，如果用人单位提前三十日以书面形式通知您，或者额外支付您一个月工资后，可以解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。经济补偿的计算标准与协商一致解除相同。

二、违法辞退与赔偿金

• 如果用人单位在没有充分法律依据或未遵循法定程序的情况下解除与您的无固定期限劳动合同，那么这可能构成违法辞退。在这种情况下，您有权要求用人单位继续履行劳动合同，或者如果劳动合同已无法继续履行，用人单位需要按照经济补偿标准的两倍向您支付赔偿金。赔偿金的计算年限自用工之日起计算。

三、特殊情况考虑

• 如果您的月工资高于当地职工月平均工资的三倍，那么经济补偿或赔偿金的支付标准将按照当地职工月平均工资的三倍来计算，且最高不超过十二年。

四、建议与行动

1. 了解权益：

   • 在面临辞退时，您有权了解自己的权益和赔偿标准。建议您仔细阅读劳动合同和相关的法律法规，以确保自己的权益得到充分保障。

2. 与用人单位沟通：

   • 在辞退过程中，与用人单位保持积极沟通是非常重要的。您可以尝试与用人单位协商解除劳动合同的条件和赔偿标准，以达成双方都能接受的解决方案。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果您对用人单位的辞退决定或赔偿标准有异议，或者您认为用人单位存在违法辞退的行为，那么您可以寻求专业律师的帮助。律师可以为您提供法律咨询和代理服务，帮助您维护自己的合法权益。

综上所述，无固定期限劳动合同员工因部门架构调整岗位撤销时的赔偿问题需要根据具体情况进行判断。建议您在了解自己的权益和赔偿标准后，与用人单位进行积极沟通，并在必要时寻求法律帮助以确保自己的权益得到妥善保障。