结论：是否需要开两次结清证明，需分情况讨论，具体如下：

1. 两次借款独立且无关联
   若两次借款是独立的法律关系（例如：两次借款合同编号不同、借款金额独立、还款时间独立），且出借方要求分别证明每次借款的结清状态，则需要分别开具两次结清证明。例如，第一次借款10万元已还清，需开具对应证明；第二次借款5万元还清后，也需单独开具证明。

2. 两次借款合并处理或存在关联
   若两次借款被合并为一个账户管理（例如：同一借款合同下的分期放款），或出借方明确表示只需一份证明覆盖全部借款，则可能只需开具一份结清证明。但需注意：

   • 需确认借款合同中是否约定“分期放款视为同一借款”；
     
   • 需与出借方协商一致，避免后续因证明效力产生争议。

实务建议：

• 优先书面确认：无论开一次还是两次证明，建议通过书面形式（如邮件、短信）与出借方确认需求，避免口头约定导致纠纷；
  
• 核对证明内容：结清证明需明确载明“借款合同编号、借款金额、还款时间、无未结清款项”等关键信息，防止内容模糊引发风险；
  
• 保留还款凭证：即使开具了结清证明，也需留存还款记录（如银行转账凭证、收据），以备不时之需。
  

若您有具体借款合同或还款细节需要分析，可直接向我咨询，我会结合实际情况进一步解答。