有承包合同的林地被征用时，补偿金的归属需根据具体情况来确定，主要包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物及林木补偿费等几个方面。以下是对此问题的详细分析：

1. 土地补偿费：

   • 通常情况下，土地补偿费归农村集体经济组织所有，因为林地的所有权归农村集体。然而，集体经济组织往往会通过民主议定程序，在本集体经济组织内部分配土地补偿费。如果承包方作为集体经济组织成员，可能会按一定比例获得部分土地补偿费。但具体分配比例和方式需依据当地政策和集体经济组织的规定。

2. 安置补助费：

   • 安置补助费旨在安置因土地被征收而失去生活来源的农业人口。如果承包方需要安置相关农业人口，则安置补助费应支付给承包方；若由农村集体经济组织统一安置，则支付给集体经济组织。例如，若承包方是个人，且其家庭成员因林地被征用而失去生活来源，那么安置补助费就应支付给该个人。

3. 地上附着物及林木补偿费：

   • 此项补偿归地上附着物及林木的所有者所有。若林地上的附着物和林木是承包方种植或建造的，则该部分补偿费应归承包方所有。比如，承包方在林地上种植了经济林木，当林地被征用时，这些林木的补偿费就应归承包方。

4. 承包经营权补偿：

   • 承包经营权是承包方依法享有的权利，当林地被征用导致承包经营权无法继续行使时，承包方有权获得相应的补偿。这种补偿通常基于承包合同的剩余期限、经营投入及预期收益等因素来确定。

特殊情况下的补偿金归属：

• 合同约定：如果承包合同中有特别约定，并且该约定不违反法律法规，那么补偿金的归属应按照合同约定执行。例如，合同中可能明确规定了土地补偿费、安置补助费等具体归属情况。

• 法律规定调整：在某些特殊情况下，如果存在其他法律规定的情形，补偿金的归属可能会有所调整。比如，当地政府可能出台了关于林地征用补偿的具体政策或规定，这些政策或规定可能对补偿金的归属产生直接影响。

建议与注意事项：

• 在签订承包合同时，应明确约定林地被征用时补偿金的归属问题，以避免后续纠纷。
• 当林地被征用时，承包方应及时了解当地政策和集体经济组织的分配方案，确保自己的合法权益得到保障。
• 如果对补偿金的归属存在争议，可以通过协商、调解、仲裁或诉讼等方式来解决纠纷。在此过程中，建议承包方保留好相关证据，如承包合同、林地使用证明、地上附着物及林木的权属证明等。

综上所述，有承包合同的林地被征用时，补偿金的归属需综合考虑多个因素。在实际操作中，如果承包方对此有疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。