当土地被占时，您可以根据具体情况选择以下部门进行处理：

1. 自然资源主管部门（原国土资源局）

   • 适用情形：主要处理土地权属争议、违法占地建设等土地违法行为。如果您发现有人未经批准非法占用您的土地进行建设，如搭建建筑物、构筑物等，或者土地权属存在争议，都可以向自然资源主管部门反映。
   • 处理方式：您可以拨打全国统一的“12336”国土资源违法举报电话，或者前往当地自然资源主管部门的官方网站、微信公众号等平台进行举报。自然资源主管部门会依法进行调查核实，并根据调查结果采取相应的处理措施，如责令停止违法行为、限期改正、没收违法所得、罚款等。

2. 农业农村主管部门

   • 适用情形：特别适用于涉及农村土地承包经营权纠纷的情况。如果您的承包地被他人侵占用于非农业用途，或者发包方非法收回、调整您的承包地，您可以向农业农村主管部门投诉。
   • 处理方式：您可以向当地农业农村主管部门（如农业农村局）投诉，请求其协助解决纠纷。农业农村主管部门会根据相关法律法规和政策规定，对投诉事项进行调查处理，维护您的合法权益。

3. 乡级人民政府或县级以上人民政府

   • 适用情形：对于单位之间的土地争议，或者个人与个人之间、个人与单位之间的土地所有权和使用权争议，如果协商不成，可以向乡级人民政府或者县级以上人民政府申请处理。
   • 处理方式：人民政府会组织相关部门进行调查和处理，包括调解和裁决。如果您对人民政府的处理决定不服，还可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

4. 公安机关

   • 适用情形：如果土地侵占行为涉嫌犯罪，如非法占用农用地罪等，您应及时向当地公安机关报案。
   • 处理方式：公安机关会依法立案侦查，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

在处理土地被占问题时，您还需要注意以下几点：

• 确认土地权属：首先，您需要明确土地的权属关系，查看是否有合法的土地使用权证书或其他相关证明文件。这是后续维权的基础。
• 收集证据：包括现场照片、视频、证人证言等，以证明土地被侵占的事实。这些证据在后续处理过程中将起到关键作用。
• 保持冷静和理性：在处理过程中，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为，以免加剧矛盾或引发不必要的法律纠纷。

如果通过行政途径无法解决问题，您还可以选择向人民法院提起诉讼。人民法院将根据相关法律法规和事实证据进行审理，并作出公正的判决。

希望以上信息能对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。