结论前置：信用卡恶意透支的立案标准主要依据透支数额，并结合持卡人的行为表现、非法占有目的以及有效催收情况来综合判断。具体来说，恶意透支数额在五万元以上的，公安机关将予以立案追诉。

详细分析：

1. 数额标准：

   • 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理妨害信用卡管理刑事案件具体应用法律若干问题的解释》（2018年修正），恶意透支数额在五万元以上的，应认定为刑法第一百九十六条规定的“数额较大”，公安机关将予以立案追诉。
   • 数额在五十万元以上不满五百万元的，认定为“数额巨大”；数额在五百万元以上的，认定为“数额特别巨大”。这些数额标准都是基于公安机关刑事立案时尚未归还的实际透支本金数额，不包括利息、复利、滞纳金、手续费等发卡银行收取的费用。

2. 行为表现与非法占有目的的认定：

   • 恶意透支不仅要求数额达到标准，还要求持卡人具有非法占有目的。这通常通过持卡人的行为表现来判断，如明知没有还款能力而大量透支、使用虚假资信证明申领信用卡后透支、透支后逃匿或改变联系方式逃避银行催收等。
   • 持卡人透支后通过抽逃、转移资金、隐匿财产等方式逃避还款，或者使用透支的资金进行犯罪活动，也将被认定为具有非法占有目的。

3. 有效催收的认定：

   • 有效催收是判断信用卡恶意透支的重要条件之一。催收必须发生在透支超过规定限额或期限后，且采用能够确认持卡人收悉的方式（持卡人故意逃避催收除外）。
   • 两次催收至少间隔三十日，并符合催收的有关规定或约定。银行需要提供电话录音、信息送达记录、信函送达回执、电子邮件送达记录等原始证据材料，且有银行工作人员签名和银行公章，以证明催收的有效性。

4. 法律后果与免责情形：

   • 若持卡人恶意透支数额较大，构成信用卡诈骗罪，将依法追究刑事责任。然而，如果持卡人在提起公诉前全部归还或者具有其他情节轻微情形，检察机关可以不起诉；在一审判决前全部归还或者具有其他情节轻微情形的，法院可以免予刑事处罚。
   • 但需注意的是，曾因信用卡诈骗受过两次以上处罚的持卡人，不适用上述免责条款。

举例说明： 假设某持卡人透支了六万元，且经发卡银行两次有效催收后超过三个月仍未归还。同时，该持卡人明知自己没有还款能力而大量透支，且透支后逃匿以逃避银行催收。在这种情况下，该持卡人的行为就构成了信用卡恶意透支，且数额达到了立案追诉的标准，公安机关将予以立案追诉。

总结与建议： 信用卡恶意透支的立案标准是一个综合考量体系，涉及数额、行为表现、非法占有目的以及有效催收等多个方面。作为持卡人，应合理使用信用卡，避免恶意透支带来的法律风险和经济损失。如果面临信用卡透支问题，建议及时与银行沟通并寻求解决方案，以避免不必要的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。