债权转让协商还款后，结清证明应由债务人开具。以下是对此结论的详细解释：

在债权转让的情境中，当债权人与受让人就债权转让达成一致，并且债务人同意与受让人协商还款后，债务人需要向受让人出具结清证明。这是因为结清证明是债务人确认其已经履行完还款义务的重要凭证，也是受让人确认其债权已经得到实现的关键证据。

从法律角度来看，结清证明通常包含以下要素：

1. 债务人的身份信息：包括债务人的姓名、身份证号码等，以确认债务人的身份。
2. 还款金额：明确债务人已经偿还的金额，以证明债务已经得到部分或全部清偿。
3. 还款时间：记录债务人还款的具体时间，以确认还款的时效性。
4. 债务人的签字或盖章：债务人的签字或盖章是结清证明的有效证明，表明债务人认可该结清证明的内容。

在债权转让协商还款后，受让人有权要求债务人出具结清证明，以确认其债权已经得到实现。如果债务人拒绝出具结清证明，受让人可以依据债权转让协议和还款记录等证据，通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，债权转让协商还款后，结清证明应由债务人开具，以确认债务已经得到清偿，并保障受让人的合法权益。如果你在此过程中遇到任何问题，可以直接向我咨询。