核心结论：甲方延误工期按总日历天数计算赔偿时，通常需结合合同约定、实际延误天数、双方过错程度及实际损失等因素综合确定，具体计算方式需分情况讨论。以下是详细分析：

1. 合同有明确约定时
   若合同中已约定“延误工期按总日历天数计算违约金”（例如“每延误一天，按合同总价的0.1%支付违约金”），则直接按合同条款执行。此时需注意：

   • 违约金上限：根据《民法典》第585条，若约定的违约金过分高于实际损失（通常超过损失的30%），甲方可请求法院或仲裁机构调整；若过低，乙方可请求增加。
     
   • 总日历天数定义：需明确是否包含法定节假日、不可抗力导致的停工天数等。若合同未排除，则按自然日计算；若约定“工作日”，则需扣除周末及法定假日。

2. 合同未约定或约定不明时
   若合同未约定违约金，乙方可主张实际损失赔偿，需提供证据证明因甲方延误导致的直接损失（如设备租赁费、人工闲置费、管理成本增加等）。此时：

   • 赔偿范围：仅限实际损失，不包括预期利润（除非合同明确约定）。
     
   • 举证责任：乙方需证明损失与甲方延误的因果关系（例如：延误导致后续工序无法进行，产生额外费用）。
     
   • 总日历天数的作用：作为计算损失的参考依据（如按日计算的租赁费用、工资等）。

3. 存在免责事由时
   若甲方延误因不可抗力（如自然灾害、政府行为）或乙方原因（如未按时提供施工条件、设计变更）导致，甲方可主张免责或部分免责。此时需：

   • 及时通知：甲方需在延误发生后及时通知乙方，并提供证明材料（如政府文件、气象报告）。
     
   • 减损义务：甲方需采取合理措施减少损失（如调整施工计划），否则可能承担扩大损失的责任。

实务建议：

• 签订合同时，建议明确约定延误工期的违约金计算方式（如按总日历天数、合同总价比例等），并约定免责条款。
  
• 发生延误时，及时固定证据（如施工日志、沟通记录、损失凭证），避免口头协商导致举证困难。
  
• 若争议较大，可委托第三方机构（如造价咨询公司）评估实际损失，为协商或诉讼提供依据。
  

如有具体合同条款或案件细节，可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您分析。