公司从两个股东增加到三个股东，主要涉及的是公司股权结构的变更，这通常需要通过一系列法律程序和文件来完成。以下是从不同角度对这一问题的详细解答：
一、法律程序与文件准备
股东会决议：
- 首先，需要召开股东会，就新增股东的事宜进行讨论并形成决议。决议内容应包括新增股东的姓名或名称、出资方式、出资额、出资时间等关键信息。
- 股东会决议是新增股东的重要法律文件，它证明了其他股东对新增股东的认可和接纳。
修改公司章程：
- 根据《公司法》的规定，公司章程是公司的基本法律文件，它规定了公司的组织结构、股东权利与义务等重要事项。
- 新增股东后，需要修改公司章程，将新增股东的信息、出资情况等纳入其中，并确保所有股东在公司章程上签字或盖章。
工商变更登记：
- 完成股东会决议和修改公司章程后，需要向工商行政管理部门申请变更登记，将新增股东的信息、出资情况等更新到公司的工商档案中。
- 工商变更登记是新增股东生效的必要程序，它确保了公司股权结构的合法性和透明度。
二、股权转让与出资方式
股权转让：
- 如果新增股东是通过受让原股东的股权而加入的，那么需要签订股权转让协议，明确转让的股权比例、价格、支付方式等关键条款。
- 股权转让协议是保护双方权益的重要法律文件，它确保了股权转让的合法性和有效性。
出资方式：
- 新增股东可以选择以货币、实物、知识产权、土地使用权等方式出资。如果以非货币方式出资，需要评估作价并办理相应的产权过户手续。
- 出资方式的选择应根据公司的实际需求和新增股东的实际情况来确定，以确保公司的资本充足和运营稳定。
三、法律后果与注意事项
法律后果：
- 新增股东后，公司的股权结构将发生变化，这可能影响公司的决策机制、利润分配等事项。因此，在新增股东前，应充分考虑这些因素并制定相应的应对措施。
- 新增股东应遵守公司章程和法律法规的规定，履行股东义务并享有股东权利。如果新增股东违反相关规定或损害公司利益，其他股东可以依法追究其责任。
注意事项：
- 在新增股东前，应对新增股东的资信情况、出资能力等进行充分调查，以确保其具备成为公司股东的资格和条件。
- 新增股东后，应及时更新公司的股东名册、出资证明书等文件，以确保公司股权结构的准确性和清晰度。
- 如果新增股东涉及外资或特殊行业（如金融、电信等），还需要遵守相关法律法规的特别规定并办理相应的审批手续。
总结来说，公司从两个股东增加到三个股东需要召开股东会形成决议、修改公司章程、办理工商变更登记等法律程序，并明确股权转让与出资方式等关键事项。在操作过程中，应注意法律后果与注意事项，以确保新增股东的合法性和有效性。如果你在这一过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。