结论：股东投资款备注公司买车，从合法性角度而言，若该款项确实用于公司购车且符合公司章程和法律规定，则是合法的；从风险角度而言，存在一定风险，主要包括资金用途被质疑的风险、税务风险以及股东权益纠纷风险。
详细分析：
合法性分析：
- 资金用途合法性：股东投资款用于公司购车，本质上属于公司资本的运用。只要该购车行为符合公司章程的规定，且购车资金确实用于公司运营需要（如购置生产设备、交通工具等），则该行为是合法的。
- 备注的合法性：在转账时备注“公司买车”，主要是为了明确资金用途，便于公司财务管理和审计。这种备注本身并不改变资金性质，只要资金实际用途与备注相符，就不存在违法问题。
风险分析：
- 资金用途被质疑的风险：如果股东投资款备注公司买车，但实际并未用于购车，或者购车行为与公司运营无关，那么这种备注就可能成为质疑资金用途的依据。在极端情况下，如果涉及挪用资金等违法行为，股东可能面临法律责任。
- 税务风险：如果股东投资款被错误地视为借款或分红，而实际上并未按照税法规定进行税务处理（如缴纳个人所得税或企业所得税），则可能引发税务风险。因此，在备注和实际使用资金时，应确保符合税法规定。
- 股东权益纠纷风险：如果股东之间对投资款的使用存在争议，或者公司章程对投资款的使用有明确规定但未得到遵守，那么备注“公司买车”可能成为股东之间纠纷的焦点。在这种情况下，股东应通过协商、调解或诉讼等方式解决纠纷。
建议：
- 明确资金用途：在转账时，应确保备注与实际资金用途相符，并保留相关证据（如购车合同、发票等）以证明资金用途的合法性。
- 遵守公司章程和法律规定：在使用股东投资款时，应严格遵守公司章程和法律规定，确保资金用于公司运营需要，并避免挪用资金等违法行为。
- 加强财务管理和审计：公司应建立健全的财务管理和审计制度，定期对资金使用情况进行审计和检查，确保资金使用的合法性和合规性。
- 及时咨询专业律师：如果股东对投资款的使用存在疑问或争议，应及时咨询专业律师，了解相关法律规定和风险点，并寻求合法合规的解决方案。
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