分公司不能不经过总公司而自行注销。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、法律主体与经营资格角度
法律主体：分公司作为总公司的分支机构，并不具备独立的法人资格。其民事责任由总公司承担，这意味着分公司的所有法律行为和后果都直接关联到总公司。因此，分公司的注销决策不能独立于总公司而作出。
经营资格：分公司的经营资格和权限均来源于总公司的授权。一旦总公司决定注销分公司，这些授权和经营资质将随之失效。分公司因此无法再以原有的模式继续合法经营，故没有自行注销或不注销的合理依据。实际上，分公司的注销必须得到总公司的明确指示和授权。
二、行政管理要求角度
从工商行政管理部门等政府机构的视角来看，分公司的注销需要遵循一定的行政程序和规定。这些程序通常要求总公司作为设立主体参与注销过程，以确保市场主体登记信息的准确性和市场秩序的稳定。如果分公司试图不经过总公司而自行注销，将可能导致管理上的混乱和市场主体信息的不一致。
三、注销程序与法律责任角度
注销程序：根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，分公司的注销需要按照法定的程序进行。这通常包括向相关政府部门（如工商行政管理部门）提交注销申请，并完成清算、税务注销等一系列手续。这些程序要求总公司作为设立主体参与并确认注销决策。
法律责任：在注销过程中，必须确保分公司的财务和法律责任得到妥善处理。这既是为了保护债权人的合法权益，也是为了维护市场的公平和正义。如果分公司存在未了结的债务或法律事务，总公司需要与相关部门协商并按照规定处理这些问题。分公司不能自行决定如何处理这些法律责任，而必须遵循总公司的指示和法律法规的规定。
四、实际操作建议
总公司决策：如果总公司决定注销分公司，应通过有效的内部决策机制（如董事会决议、股东会决议）形成正式决定，并书面记录该决定内容。
成立清算组：总公司应迅速组建清算组，负责清理分公司的财产、编制资产负债表、处理未了结业务、清缴税款及债权债务等。
通知与公告：清算组需在成立后及时通知所有已知债权人，并在指定报纸上发布公告，告知债权人申报债权的期限和方式。
办理注销手续：完成清算后，总公司应向分公司登记机关提交注销登记申请书、分公司营业执照、清算报告等文件，申请注销分公司登记。
咨询与协助：在整个注销过程中，如果总公司或分公司遇到任何法律问题或需要更详细的建议，可以直接向我咨询。我将根据具体情况提供专业的法律意见和协助。
综上所述，分公司不能不经过总公司而自行注销。这一决策必须得到总公司的明确指示和授权，并遵循相关法律法规和行政程序的规定。如果您在此方面遇到具体的法律问题或需要更详细的建议，请直接向我咨询。