关于“已付工程款由谁举证”的问题，在实际施工人员起诉发包人的情境中，发包人应当对其已付承包人工程款数额承担举证责任。以下是对这一结论的详细解释：
举证责任分配：
- 根据最高法的裁判观点，在实际施工人员难以接触并掌握发包人与承包人之间的付款证据时，要求实际施工人员对发包人的付款情况承担举证责任是不切实际的，也与司法解释所规定的保护实际施工人的意旨相违背。
- 因此，发包人作为付款方，应当对其已付工程款数额承担举证责任。如果发包人不积极举证或者提供的证据不能证明其已付工程款数额，将承担举证不能的后果。
法律依据：
- 这一规定在《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（二）》中有所体现，该解释明确规定了发包人在欠付工程款范围内对实际施工人承担责任，并应查明发包人欠付承包人工程款的数额。
实践意义：
- 这一举证责任分配原则有助于保护实际施工人的合法权益，确保他们能够获得应有的工程款。
- 同时，也促使发包人更加规范地管理工程款项，避免因举证不能而承担不必要的法律责任。
综上所述，在已付工程款的举证责任上，发包人应当承担主要责任。如果发包人未能提供充分证据证明其已付工程款数额，将可能按照转包人欠付实际施工人的工程款数额承担付款责任。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的解释，请直接向我咨询。