面对违建当事人不配合调查的情况，我们可以采取一系列综合措施来确保法律程序的合规性与实际操作的有效性。以下是一些详细的步骤和建议：
一、明确法律依据与责任主体
首先，要依据《中华人民共和国城乡规划法》及相关法律法规，明确未取得建设工程规划许可证或未按许可证规定建设的建筑均被视为违法建设。同时，县级以上地方人民政府城乡规划主管部门及城管等相关部门，是负有调查取证、认定违建以及依法处理职责的主体。
二、依法进行调查取证与责令改正
调查取证：规划、城管等部门应依法对疑似违建进行详尽的调查，这包括查阅相关的审批文件、进行现场勘查、询问相关人员等，以全面确定建筑是否违法。
责令停止建设与处罚：一旦建筑被认定为违建，应立即下达《责令停止违法行为通知书》，并根据《城乡规划法》的相关规定，视具体情况作出限期改正、罚款、限期拆除或没收实物等决定。
文书送达：确保所有法律文书能够有效地送达违建当事人。可以采用留置送达、邮寄送达（特快专递）或公告送达等方式，并务必保留好送达凭证，以证明法律文书的已送达。
三、进行催告、沟通与协商
催告履行：在限期拆除期限届满前，应以书面形式催告违建当事人履行拆除义务，并明确告知其享有陈述、申辩的权利。
积极沟通：工作人员应主动与违建当事人进行深入沟通，了解其不配合的具体原因，耐心解答其疑问，并尽力争取其自行拆除违建，从而避免进入强制拆除程序。
相邻业主参与：可以鼓励相邻的业主与违建当事人进行友好协商，向其说明违建对居住环境的影响，共同维护良好的居住环境。
四、申请强制拆除与法律诉讼
强制拆除：如果违建当事人在逾期后仍不拆除违建，且不申请行政复议或提起行政诉讼，相关部门可以依法组织强制拆除。在拆除前，应制定详细的拆除方案，确保拆除过程的安全有序，并做好证据保全工作。拆除费用应由违建当事人承担。
法律诉讼：如果协商无果，相邻的业主或相关部门可以向人民法院提起诉讼，请求法院判令违建当事人拆除违建并承担相应的法律责任。在诉讼过程中，需要提供充分的证据来证明违建行为与损害之间的因果关系。
五、鼓励举报控告与加强宣传教育
举报控告：应鼓励任何单位和个人向城乡规划主管部门或其他有关部门举报或控告违建行为。相关部门应及时受理、核查并处理这些举报或控告。
宣传教育：加强城乡规划法律法规的宣传教育，提高业主的法律意识和规划意识，促使其自觉遵守法律法规，并积极配合执法工作。
综上所述，面对违建当事人不配合调查的情况，我们应综合运用法律手段、行政手段与教育引导相结合的方式，既确保法律的严肃性与权威性，又注重与违建当事人的沟通与协商，以寻求最佳解决方案，从而维护城乡规划的顺利实施和公共利益的保护。