核心结论：若耕地旁两三百平米的坟被划为基本农田，可先确认划定合法性，若不合法可申请复核或调整；若合法，则需遵守基本农田保护规定，同时可依法申请迁移坟墓。以下是具体分析：
确认基本农田划定的合法性
- 审查划定程序：基本农田的划定需要遵循严格的法定程序，包括土地利用总体规划的编制、论证、公示、报批等环节。你可以向当地自然资源部门（原国土资源部门）申请信息公开，了解该地块被划为基本农田的具体依据、程序是否合法合规。如果发现划定程序存在违法违规行为，如未经过合法的论证、公示程序，或者未按照规定的权限进行审批等，那么该划定行为可能无效。
- 核实规划依据：查看当地的土地利用总体规划，确认该坟地所在区域是否确实被规划为基本农田。土地利用总体规划是划定基本农田的重要依据，如果规划本身存在问题，或者该坟地因特殊情况（如历史遗留问题、地形地貌等）不应被划入基本农田，那么你可以向相关部门提出异议。
若基本农田划定不合法
- 申请复核：你可以向当地自然资源部门提出书面申请，要求对基本农田的划定进行复核。在申请中，详细说明你认为划定不合法的理由，并提供相关证据，如土地利用现状图、历史照片、规划文件等。自然资源部门在收到申请后，会进行调查核实，并根据调查结果作出处理决定。
- 申请调整：如果经过复核，确认基本农田划定存在错误，你可以向当地政府或自然资源部门申请调整基本农田范围。调整基本农田需要符合一定的条件和程序，如因重大建设项目需要、生态保护需要等。在申请调整时，你需要提供充分的理由和证据，说明调整的必要性和合理性。
若基本农田划定合法
- 遵守基本农田保护规定：一旦该坟地被合法划定为基本农田，就需要严格遵守基本农田保护的相关规定。根据《基本农田保护条例》等法律法规，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动。因此，你需要停止在该地块上进行与基本农田保护规定相违背的行为。
- 申请迁移坟墓：如果因特殊原因需要迁移该坟墓，你可以依法向当地民政部门提出申请。在申请时，需要提供相关的证明材料，如亲属关系证明、坟墓所有权证明等。民政部门在收到申请后，会进行审核，并根据相关规定作出处理决定。如果申请获得批准，你需要按照民政部门的要求，选择合适的地点迁移坟墓，并办理相关的手续。