在闯红灯与电动三轮车相撞的情况下，保险公司的赔偿问题确实需要根据多个因素来综合判断。以下是对此问题的详细解答：
一、交强险的赔偿情况
交强险，即机动车交通事故责任强制保险，其设立初衷是为了保障交通事故中的受害人能够得到及时有效的救治和经济赔偿。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，无论被保险车辆在事故中有无责任，交强险都会在责任限额范围内进行赔偿。
有责赔偿：如果机动车一方在事故中被认定负有一定责任，交强险会在有责责任限额内进行赔偿。具体限额包括：死亡伤残赔偿限额18万元，医疗费用赔偿限额1.8万元，财产损失赔偿限额2000元。
无责赔偿：即使机动车一方被认定无责任，交强险仍会在无责责任限额内给予赔偿。具体限额为：死亡伤残赔偿限额1.8万元，医疗费用赔偿限额1800元，财产损失赔偿限额100元。
二、商业险的赔偿情况
商业险，如第三者责任险，其赔偿则相对复杂，主要依据保险合同的约定以及事故责任的认定来确定。
一般情况：在商业险中，保险公司通常根据被保险车辆在事故中所承担的责任比例进行赔偿。如果电动三轮车闯红灯并负事故主要或全部责任，而机动车一方责任较小或无责任，那么机动车的商业险可能赔偿较少甚至不赔偿。这是因为商业险主要承担的是被保险人因交通事故对第三方造成的损害赔偿责任，而电动三轮车闯红灯属于违反交通规则的行为，对事故的发生负有直接责任。
特殊情况：然而，也存在一些特殊情况可能影响商业险的赔偿结果。例如，保险合同中存在争议条款、保险公司未对免责条款进行明确说明等。在这些情况下，通过法律途径可能会争取到一定的赔偿。此外，如果电动三轮车购买了相应的商业车险（如车损险、第三者责任险等），其自身的保险也会根据具体的保险条款和事故责任认定情况进行赔偿。
三、保险公司的免责情况
需要注意的是，保险公司不赔偿的情况包括：受害人故意造成事故、电动三轮车驾驶人未取得驾驶资格、醉酒驾驶、电动三轮车被盗抢期间肇事、被保险人故意制造道路交通事故等。
四、赔偿的具体内容与责任划分
赔偿内容：包括财产损失赔偿（如车辆维修费用）、人身伤害赔偿（如医疗费用、伤残赔偿）以及其他相关费用（如施救费、停车费等）。
责任划分：电动三轮车闯红灯可能负全责或主要责任，具体视现场情节而定。机动车一方无过错的，承担不超过10%的赔偿责任。若另一方也存在违法行为（如超速、无证驾驶、酒驾等），则根据各自行为对事故发生的作用及过错严重程度，分别承担主要责任、同等责任和次要责任。
五、建议与总结
在处理此类事故时，建议各方当事人首先保持冷静，及时报警并寻求专业医疗救助。同时，积极收集相关证据材料，以便后续与保险公司或相关部门进行沟通协商。此外，也提醒广大车主和电动三轮车驾驶人在驾驶过程中一定要严格遵守交通规则，确保行车安全，避免类似事故的发生。
综上所述，闯红灯与电动三轮车相撞时，保险公司的赔偿情况需综合考虑事故的具体情况、保险政策及法律法规。在一般情况下，交强险会在责任限额内赔偿，而商业险则依据合同和责任划分赔付。同时，也需注意保险公司的免责情况和责任划分的具体规定。