公司清退员工时，补偿的确定需严格遵循相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。以下是关于公司清退员工时应如何补偿的详细解答：
一、合法解除劳动合同的补偿
协商一致解除：
- 法律依据：根据《劳动合同法》第三十六条，如果公司与员工协商一致解除劳动合同，需支付经济补偿金。
- 补偿标准：按照员工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的经济补偿金；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿金。这里的月工资指的是劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
劳动者存在法定过错解除：
- 法律依据：根据《劳动合同法》第三十九条，如果劳动者存在法定过错（如严重违反公司规章制度、严重失职等），公司可以解除劳动合同且无需支付经济补偿金。
无过失性辞退与经济性裁员：
- 法律依据：分别依据《劳动合同法》第四十条和第四十一条，对于无过失性辞退和经济性裁员，公司同样需要按照工作年限支付经济补偿金。
二、其他补偿
未休年假补偿：
- 公司应按照员工未休年假的天数，支付三倍的正常工资作为补偿。这是对员工未享受年假权益的补偿。
未支付工资及福利：
- 在清退员工时，公司必须结清员工应得的全部工资报酬，并补缴社会保险等费用。这是确保员工离职前经济权益得到妥善处理的重要步骤。
三、违法解除劳动合同的赔偿
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四十八条和第八十七条，如果公司违反规定解除或终止劳动合同，需按照经济补偿标准的二倍向员工支付赔偿金。
- 补偿标准：赔偿金计算方式与合法解除劳动合同的经济补偿金相同，但金额为其两倍。即按员工在本单位的工作年限，每满一年支付两个月工资的赔偿金；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付一个月工资的赔偿金。
四、补偿流程
通知工会：公司在辞退员工前，应事先将理由通知工会，并研究工会的意见。这是确保员工权益得到保障的重要程序。
书面通知员工：公司应向员工发出明确的辞退通知，包括辞退原因、日期、补偿标准等。这是确保员工了解自身权益和后续处理流程的必要步骤。
办理离职手续：包括工作交接、工资结算、社会保险及住房公积金减员等。同时，公司需按约定支付经济补偿金或赔偿金，确保员工离职手续顺利办理。
综上所述，公司在清退员工时，必须严格遵守《劳动合同法》等相关法律法规，确保合法合规地处理员工的补偿事宜。无论是合法解除还是违法解除，都应按照规定的标准支付相应的经济补偿金或赔偿金，并妥善处理好员工的未休年假、工资及福利等问题。如果员工对公司的辞退行为或补偿金额有异议，可以通过劳动仲裁等法律途径来维护自己的合法权益。