根据《药品管理法》及相关规定，药店配送单的保存期限通常为不少于5年。具体分析如下：

1. 法律依据
   根据《药品经营质量管理规范》（GSP）第一百六十八条，药品经营企业（包括药店）的“销售记录”应当保存至药品有效期满后5年。配送单作为销售环节的关键凭证，属于销售记录的范畴，因此需遵循此规定。

2. 特殊情形说明

   • 若药品本身有效期较短（如某些生物制品），保存期限需以药品有效期满后5年为准，而非单纯从配送日期计算。
     
   • 若法律或地方性法规对特定药品（如麻醉药品、精神药品）有更严格的保存要求，需优先适用更长期限的规定。

3. 法律后果
   未按规定保存配送单可能面临行政处罚，包括警告、罚款（《药品管理法》第一百二十六条）。若因保存不当导致药品来源无法追溯，还可能承担民事赔偿责任。

建议：药店应建立电子或纸质档案，按药品批次分类保存配送单，并定期核查有效期，确保合规。如有其他疑问，可直接向我咨询药品合规领域的问题。