亲子鉴定通常不能直接鉴定孙女和奶奶的关系，但可以通过间接方式推断。以下从不同角度为你详细分析：

一、亲子鉴定的直接原理与限制

亲子鉴定，主要是通过对比DNA样本中的遗传标记，来确定亲子关系的生物学证据。在常规的亲子鉴定中，我们通常比较的是父母与子女之间的DNA，因为子女会继承父母各一半的遗传物质。然而，孙女与奶奶之间并不存在直接的亲子关系，她们之间隔了一代，因此，直接通过亲子鉴定来确定孙女和奶奶的关系在技术上是不准确的。

二、间接推断的可能性

尽管不能直接鉴定，但在某些情况下，我们可以通过间接的方式来推断孙女和奶奶的关系。例如：

1. 通过父亲作为中介：如果孙女的父亲（即奶奶的儿子）愿意参与鉴定，我们可以先确定父亲与孙女之间的亲子关系，再结合父亲与奶奶之间的亲子关系（如果已知或可鉴定），从而间接推断出孙女与奶奶的关系。

2. 家族遗传标记分析：在某些特殊情况下，如果家族中有特定的遗传标记或疾病，且这些标记或疾病在奶奶和孙女身上都有体现，那么这也可以作为推断她们之间关系的一种辅助证据。但这种方法并不准确，且需要专业的遗传学知识和分析。

三、法律建议与实际操作

1. 法律建议：如果你需要证明孙女与奶奶的关系，最直接且有效的方式是查找和提供相关的家族记录、出生证明、户口本等官方文件。这些文件通常能够清晰地表明家庭成员之间的关系。

2. 实际操作：在实际操作中，如果确实需要通过DNA鉴定来辅助证明关系，建议咨询专业的DNA鉴定机构，了解他们是否提供相关的间接鉴定服务，并了解鉴定的准确性和可靠性。同时，也要考虑到鉴定费用、时间成本以及可能带来的家庭关系影响等因素。

四、特殊情况下的考虑

在某些特殊情况下，如家庭纠纷、遗产继承等，可能需要更确凿的证据来证明孙女与奶奶的关系。在这种情况下，除了上述的官方文件和DNA鉴定外，还可以考虑寻找其他证人或证据，如家族长辈的证言、家族照片、视频等，以形成完整的证据链。

总结来说，亲子鉴定通常不能直接鉴定孙女和奶奶的关系，但可以通过间接方式推断。在实际操作中，建议优先考虑官方文件和其他辅助证据来证明关系。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。