住房贷款扣款金额不足是否算逾期需分情况讨论，具体如下：

1. 银行未进行二次补扣且未宽限
   若银行在约定扣款日仅扣划部分金额（如账户余额不足导致扣款失败），且未在当日或宽限期内发起二次补扣，同时贷款合同未约定“部分还款视为有效”的条款，则剩余未还部分将直接构成逾期。此时银行可能按合同约定收取罚息，并可能将逾期记录上报征信系统。

2. 银行进行二次补扣或合同约定宽限期
   若银行在扣款失败后于当日或合同约定的宽限期（如1-3日）内发起二次补扣，且补扣成功覆盖当期应还金额，则不视为逾期。但需注意：

   • 宽限期是否适用需以贷款合同条款为准，部分银行可能无宽限期；
     
   • 即使补扣成功，若因扣款失败导致银行系统生成逾期记录，需及时联系银行核实并申请修正。

3. 部分还款的合同约定效力
   若贷款合同明确约定“还款金额不足时，已扣部分视为有效还款，剩余部分需在XX日内补足，否则构成逾期”，则需按合同执行。例如：合同约定“扣款失败后需在3日内补足差额”，若未在期限内补足，则从逾期日起计收罚息。

实务建议：

• 立即通过银行APP、网银或客服确认扣款失败原因及剩余应还金额；
  
• 若因账户余额不足导致扣款失败，需在当日或宽限期内补足差额（建议通过转账方式留存凭证）；
  
• 若已产生逾期记录，可要求银行出具《非恶意逾期证明》以降低对征信的影响；
  
• 长期资金紧张时，可申请调整还款计划（如延长贷款期限、变更还款方式），但需银行审核同意。
  

法律依据：
根据《民法典》第六百七十六条，借款人未按照约定的期限返还借款的，应当按照约定或者国家有关规定支付逾期利息。具体逾期认定标准以贷款合同条款为准。