抵押权变更申请时间主要依据抵押权变更事项的发生时间以及相关法律法规规定的办理期限来计算，以下分情况详细说明：

1. 基于合同变更的抵押权变更申请时间
   • 当抵押人与抵押权人协商一致变更抵押合同内容，例如变更被担保的主债权数额、债务履行期限、担保范围等，抵押权变更申请时间通常从双方达成变更合意并签订书面变更协议之日起算。
   • 根据《民法典》相关规定，抵押权不得与债权分离而单独转让或者作为其他债权的担保。债权转让的，担保该债权的抵押权一并转让，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。在这种情况下，如果因债权转让导致抵押权变更，申请时间一般从债权转让合同生效且通知债务人之日起算。因为债权转让自通知债务人时对债务人发生效力，此时抵押权变更的相关事宜才具备明确的申请基础。例如，甲将债权转让给乙，双方签订了债权转让协议，并及时通知了债务人丙，那么从通知到达丙之日起，就可以着手准备抵押权变更申请相关事宜。
2. 因主债权消灭等法定事由导致的抵押权变更申请时间
   • 如果主债权因履行、抵销、提存、免除等原因而消灭，抵押权也随之消灭，此时抵押权变更申请（实际上是注销抵押权登记等变更相关登记状态）时间应从主债权消灭之日起算。例如，债务人按照合同约定向债权人清偿了全部债务，主债权消灭，那么自债务清偿完毕之日起，就可以申请办理抵押权注销登记等变更手续。
   • 当抵押物被征收、征用或者灭失，导致抵押权发生变更或消灭的，申请时间从抵押物被征收、征用或者灭失的事实发生之日起算。不过，在这种情况下，可能还需要考虑抵押物价值代偿物的相关情况。如果抵押物灭失后有代偿物，抵押权可能延续至代偿物上，此时抵押权变更申请时间则要根据对代偿物的处理情况以及相关约定来确定。比如，抵押的房屋因地震灭失，但政府给予了相应的补偿款，若抵押权延续至补偿款上，那么抵押权变更申请时间可能要从确定补偿款归属等相关事宜办理完毕之日起算。
3. 办理抵押权变更登记的法定期限对申请时间的影响
   • 虽然法律没有明确规定抵押权变更申请必须在变更事项发生后的具体某一段时间内提出，但根据《不动产登记暂行条例》等相关规定，不动产登记机构应当自受理登记申请之日起30个工作日内办结不动产登记手续，法律另有规定的除外。这意味着，从抵押权变更申请提交给登记机构之日起，登记机构有一定的办理期限。为了保障自身权益，抵押权人或抵押人应在变更事项发生后，及时准备相关材料并提交变更申请，避免因拖延时间过长而导致一些不必要的法律风险，例如可能因未及时办理变更登记，在涉及抵押物的其他法律纠纷中，无法充分主张自己的抵押权权益。

在实际操作中，不同地区的登记机构可能会有一些具体的办事流程和时间要求上的差异。因此，在办理抵押权变更申请时，建议你提前向当地的不动产登记机构咨询清楚相关事宜，确保申请能够顺利、及时地办理。如果你在抵押权变更申请时间计算或其他抵押权相关法律问题上还有疑问，欢迎随时向我咨询。