结论：验资回函显示部分资金已经转出的情况下，是否还能出具验资报告，这主要取决于资金转出的时间、性质以及是否符合相关法律法规和验资程序的要求。以下从不同角度进行分析：

1. 资金转出时间与验资程序的关系：

   • 如果资金在验资报告出具前已经合法转出，并且这一转出行为符合公司章程、相关法律法规以及验资程序的要求（例如，是按照既定计划用于公司运营或偿还债务等），那么理论上仍然可以出具验资报告。但报告需要明确说明资金转出的情况，包括转出时间、原因、金额以及转出后的资金状况等，以确保报告的准确性和完整性。
   • 如果资金在验资过程中或验资报告出具前未经合法程序或未经充分说明即转出，这可能构成对验资程序的干扰或违反相关法律法规，此时出具验资报告可能会受到质疑或不被接受。

2. 资金转出的性质与合规性：

   • 资金转出的性质是判断其是否影响验资报告出具的关键因素。如果资金转出是出于合法、合理的商业目的，并且有充分的证据支持（如合同、发票、银行转账记录等），那么这种转出通常不会阻碍验资报告的出具。
   • 如果资金转出存在违法、违规或不当行为（如挪用资金、虚假出资等），那么这不仅会影响验资报告的出具，还可能引发法律责任和监管处罚。

3. 法律法规与验资标准的要求：

   • 根据相关法律法规和验资标准，验资报告应当真实、准确地反映公司的注册资本实缴情况。如果资金转出导致公司注册资本实缴情况发生变化，且这种变化未在验资报告中得到充分反映和说明，那么验资报告可能被视为不准确或不完整。
   • 因此，在出具验资报告前，必须确保所有资金转出行为都符合法律法规和验资标准的要求，并且已经在报告中得到了充分披露和说明。

建议：

• 在遇到验资回函显示部分资金已经转出的情况时，建议首先与验资机构或专业律师进行沟通，了解资金转出的具体情况以及是否符合相关法律法规和验资程序的要求。
• 如果资金转出是合法且合理的，确保在验资报告中充分披露和说明这一情况，以维护报告的准确性和完整性。
• 如果对资金转出的合法性或合理性存在疑问，或者担心这可能影响验资报告的出具，建议及时寻求法律帮助或咨询相关监管机构以获取专业指导。

后续行动：

• 如果您需要进一步了解验资报告的具体要求或资金转出的法律后果，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律解释和建议。