若公安机关移送检察院审查起诉时犯罪嫌疑人的取保候审已超期，可按以下步骤处理：

1. 立即核实超期事实
   根据《刑事诉讼法》第79条，取保候审最长不得超过12个月（对同一犯罪嫌疑人不得重复取保）。需第一时间确认：

   • 取保候审的起始日期（以《取保候审决定书》载明日期为准）；
     
   • 公安机关是否在期限届满前移送审查起诉（若未移送且未解除措施，则构成超期）；
     
   • 检察院接收案件时是否已过取保候审期限。
     若超期事实明确，需立即向办案机关提出书面异议。

2. 向检察院提出解除或变更强制措施申请
   根据《刑事诉讼法》第98条，犯罪嫌疑人、被告人及其法定代理人、近亲属或辩护人有权申请解除超期强制措施。建议：

   • 书面申请：明确指出取保候审超期的事实及法律依据，要求检察院立即解除取保候审或变更为其他非羁押措施（如监视居住）；
     
   • 同步沟通：与案件承办检察官当面或电话沟通，强调超期羁押的违法性及对犯罪嫌疑人权利的侵害；
     
   • 引用案例：可附上类似超期取保后被法院裁定违法的案例，增强说服力。

3. 向公安机关提出异议并要求纠正
   若超期系因公安机关未及时移送案件或未解除取保导致，可：

   • 向公安机关法制部门提交书面《纠正违法通知书》，要求立即解除取保候审；
     
   • 引用《公安机关办理刑事案件程序规定》第107条，明确公安机关在取保候审期限届满前应解除措施或变更强制措施；
     
   • 若公安机关拒不纠正，可向其上级机关或同级检察院申诉。

4. 申请国家赔偿（若已造成损害）
   根据《国家赔偿法》第17条，若超期取保导致犯罪嫌疑人人身自由被非法剥夺（如实际被限制出行、报到等），可：

   • 在刑事诉讼程序终结后，向作出错误决定的机关申请国家赔偿；
     
   • 赔偿范围包括：被限制人身自由的赔偿金、精神损害抚慰金等。
     需注意：若取保候审期间未实际限制人身自由，可能不构成国家赔偿情形。

5. 监督与投诉渠道

   • 向检察院控申部门投诉：要求检察院对公安机关的超期行为进行法律监督；
     
   • 向政法委或监察委反映：若办案机关存在故意拖延、违法办案等情形，可向相关部门举报；
     
   • 媒体与舆论监督：在合法合规前提下，通过媒体曝光推动问题解决（需谨慎评估风险）。

温馨提示：取保候审超期可能涉及程序违法，但需结合具体案情判断是否实际侵害权利。建议委托律师介入，通过阅卷、会见犯罪嫌疑人等方式全面核实情况，制定针对性维权策略。若有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。