结论：个人借款五千万申请支付令后，是可以进行调解的。

分析：

1. 支付令与调解的关系：

   • 支付令是债权人根据《民事诉讼法》的规定，向债务人发出的要求其履行支付义务的法律文书。它是一种非诉讼程序，旨在快速、高效地解决债权债务纠纷。
   • 调解则是在诉讼或非诉讼过程中，由第三方（如法院、调解组织等）协助双方当事人通过协商达成和解协议的方式解决纠纷。
   • 支付令的发出并不排除后续进行调解的可能性。实际上，在支付令发出后，如果债务人提出异议或双方愿意协商，调解可以作为一种有效的纠纷解决方式。

2. 调解的适用性：

   • 在个人借款五千万的案件中，如果债权人已经申请了支付令，但债务人提出异议或双方希望避免诉讼，调解是一个可行的选择。
   • 调解可以节省时间和成本，避免诉讼带来的不确定性和风险。通过调解，双方可以达成一个双方都能接受的还款计划或其他解决方案。

3. 调解的程序与效力：

   • 调解可以在法院的主持下进行，也可以由双方自行协商并邀请第三方参与。在法院主持下的调解，如果达成协议，法院会制作调解书，该调解书具有与判决书同等的法律效力。
   • 如果双方自行协商达成调解协议，可以签订书面协议并公证或寻求其他方式确保其执行力。

4. 注意事项：

   • 在进行调解前，债权人应确保支付令的合法性和有效性，即支付令的申请、发出和送达等程序应符合法律规定。
   • 债务人应认真对待支付令，如果提出异议，应及时提供充分的证据和理由。
   • 双方在调解过程中应保持诚信和合作态度，积极寻求解决方案，避免纠纷进一步升级。

建议：

• 如果您作为债权人已经申请了支付令，但希望与债务人进行调解，可以主动与债务人沟通并提出调解意愿。
• 如果债务人同意调解，双方可以协商确定调解的方式、时间和地点等事项。
• 在调解过程中，您可以寻求专业律师的协助，以确保您的权益得到充分保障。
• 如果调解成功并达成协议，建议您及时将协议内容以书面形式固定下来，并考虑进行公证或其他方式确保其执行力。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。