针对您提出的“政府发放农村土地承包合同丢了怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、理解合同丢失的影响
农村土地承包合同是确认您土地承包权益的重要法律文件，它详细记录了承包地的信息、承包期限以及双方的权利和义务。虽然合同丢失不会直接导致您权益的丧失，但为了便于权益的行使和维护，及时采取措施补办或获取替代证明是至关重要的。
二、查找留存副本
发包方处查找：
- 农村土地承包合同通常一式三份，分别由发包方（如村集体经济组织或村民委员会）、承包方（您）和乡镇政府农村经营管理部门保管。
- 您应首先前往发包方处，向村干部说明情况，申请查阅并复印留存的合同副本。请确保复印件上加盖公章，以证明其法律效力。
乡镇政府备案查询：
- 乡镇政府的农业农村办公室或相关职能部门也可能存有农村土地承包合同的备案资料。
- 您可以携带个人有效身份证件前往乡镇政府，咨询工作人员合同备案情况，并申请查阅、复印相关文件。
三、申请补办合同
若在发包方和乡镇政府处均未能找到合同副本，您可以向发包方提出补办合同的申请。具体流程如下：
提出申请：
- 撰写书面申请，详细说明合同丢失的情况、承包地的基本信息（如位置、面积、承包期限等）以及补办意愿。
审核与调查：
- 发包方会对您的申请进行审核，并可能查阅村集体的土地台账、档案等资料，以核实承包信息。
- 您可能需要提供一些辅助证据，如证人证言、土地经营权证等，以证明承包关系的真实性。
重新签订合同：
- 经核实无误后，发包方将与您重新签订内容一致的土地承包合同。
- 请确保新合同中明确记录了承包地的所有关键信息，并由双方签字确认。
备案：
- 新签订的合同需报乡镇政府农村经营管理部门备案，以确保合同的合法性和规范性。
四、法律层面固定证据
为了确保您的合法权益不受损害，即使合同丢失，也应采取法律手段固定证据：
土地经营权证：
- 若您已取得农村土地承包经营权证，该证书是承包关系的重要法律凭证。
- 即使合同丢失，凭借经营权证也能有效保障您的合法权益。
其他辅助证据：
- 收集与承包地相关的其他证据，如缴纳承包费用的收据或转账记录、对承包地进行经营管理的记录（如购买农资的凭证、土地上农作物种植或养殖的记录等）。
- 这些证据虽为间接证据，但能从侧面印证承包关系的存在和履行情况。
五、预防措施与纠纷解决
预防措施：
- 加强对重要合同的管理和保管，避免类似情况的再次发生。
- 考虑将合同复印件或电子版保存在安全的地方，以备不时之需。
纠纷解决：
- 若在补办合同过程中遭遇困难，如发包方故意刁难或拒绝补办，您可以向乡镇政府、农业农村部门等反映情况，请求协调解决。
- 在必要时，您也可考虑通过法律诉讼途径来维护自己的土地承包权益。
综上所述，农村土地承包合同丢失后，您不必过于担心，但应积极采取措施补办或获取替代证明，并确保所有文件的合法性和有效性。同时，加强合同管理也是预防类似问题的重要手段。希望这些建议能对您有所帮助。